R语言 TRAMPR包 plot.TRAMPsamples()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot.TRAMPsamples(TRAMPR)
plot.TRAMPsamples()所属R语言包：TRAMPR

                                        Plot a TRAMPsamples Object
                                         绘制一个TRAMPsamples对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Shows the peak profiles of samples in a TRAMPsamples object, showing the locations and heights of peaks for individual enzyme/primer combinations.  This is the same information that is displayed in the bottom portion of a plot.TRAMP plot, but may be useful where a TRAMP fit has not been performed yet (e.g. before a knowns database has been constructed).
在TRAMPsamples对象显示样品的峰形，不同的酶/引物组合的峰的位置和高度。这是相同的信息，显示在底部的plot.TRAMP图，但可能是有用的，在TRAMP适合尚未执行（例如，前一个已知的数据库已建成）。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'TRAMPsamples'
plot(x, sample.fk, ...)
TRAMPsamples.plotone(x, sample.fk, all.samples.global=FALSE, col=1:10,
                     xmax=NULL, mar.default=.5, mar.labels=8, cex=1)



参数----------Arguments----------

参数：x
A TRAMPsamples object, containing profiles to plot.
ATRAMPsamples对象，包含配置文件，以图。


参数：sample.fk
The sample.fk to plot.  If omitted, then all samples are plotted, one after the other (this is useful for generating a summary of all fits for printing out: see Example).
sample.fk图。如果省略，那么所有的样品被绘制，一个在另一个之后的（这是有用的，用于产生用于打印出的摘要的所有配合：见实施例）。


参数：all.samples.global
Logical: Should plots be set up for all enzyme/primer combinations present in x, even if the combinations are not present for all individual cases?  Analagous to the same argument in plot.TRAMP.  (This is useful for keeping combinations in the same place, and plotted with the same colours.)
逻辑：如果图设置为所有的酶/引物组合，目前在x的组合，即使是不存在的所有个别情况吗？ Analagous在plot.TRAMP相同的参数。 （这是用于保持在同一个地方的组合，并具有相同的颜色绘制）。


参数：col
Vector of colours to plot the different enzyme/primer combinations.  There must be at least as many colours as there are different combinations.
向量的颜色来绘制不同的酶/引物组合。至少必须有尽可能多的颜色有不同的组合。


参数：xmax
Maximum size (in base pairs) for the plots to cover. NULL (the default) uses the range of all data found in the TRAMPsamples object (rounded up to the nearest 100). NA will use the range of all data in the current sample.
图覆盖的最大尺寸（碱基对）。 NULL（默认设置）使用范围的所有数据在TRAMPsamples对象（四舍五入至最接近的100）。 NA将使用当前的样本中的所有数据。


参数：mar.default
Margin size (in lines of text) to surround the plot.
保证金的大小（行文本）环绕的图。


参数：mar.labels
Number of lines of text to be used for labels to the left of the plots.  Increase this if labels are being truncated.
要用于标签，左侧的图的文本行数。增加这个标签被截断。


参数：cex
Scaling factor for text.
缩放比例因子的文本。


参数：...
Additional arguments (ignored).
附加参数（忽略）。


参见----------See Also----------

plot.TRAMP, the plotting method for TRAMP objects, and plot.TRAMPknowns, for TRAMPknowns objects.
plot.TRAMP，TRAMP对象的绘图方法，plot.TRAMPknowns，TRAMPknowns对象。


实例----------Examples----------


data(demo.samples)

plot(demo.samples, 101)
plot(demo.samples, 117)

## Not run: [＃不运行：]
# Create a PDF file with all profiles:[创建一个PDF文件中的所有配置文件：]
pdf("all_profiles.pdf")
plot(demo.samples)
dev.off()

## End(Not run)[＃（不执行）]

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