R语言 BioSeqClass包 featureBinary()函数中文帮助文档(中英文对照)

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featureBinary(BioSeqClass)
featureBinary()所属R语言包：BioSeqClass

                                        Feature Coding by Binary Vectors
                                         二进制向量特征编码

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Sequences are coded by binary vectors.
二进制向量序列编码。


用法----------Usage----------


  featureBinary(seq,class=elements("aminoacid"))  



参数----------Arguments----------

参数：seq
a string vector for the protein, DNA, or RNA sequences.
为蛋白质，DNA或RNA序列的字符串向量。


参数：class
a list for the class of biological properties. It can  be produced by elements and aaClass.   
一个生物属性的类列表。它可以产生elements和aaClass。


Details

详情----------Details----------

featureBinary returns a matrix with M*N columns. Each row  represented features of one sequence coding by a M*N dimension 0-1 vector.  Each base/amino acid is coded as a M dimension vetor. For example:   amino acid "A" is coded by "00000000000000000001"; base "T" is coded by  "0010". The input sequences must have equal length.  
featureBinary返回一个与M * N列的矩阵。每一行代表一个M * N维0-1向量编码序列的特点。作为一个M维向量的每个碱基/氨基酸编码。例如：氨基酸的“A”编码“00000000000000000001”;碱基的“T”是由“0010”编码。必须有平等的输入序列的长度。


作者（S）----------Author(s)----------


Hong Li



举例----------Examples----------


if(interactive()){
  file = file.path(.path.package("BioSeqClass"), "example", "acetylation_K.pos40.pep")
  seq = as.matrix(read.csv(file,header=F,sep="\t",row.names=1))[,1]
  
  BIN1 = featureBinary(seq,elements("aminoacid"))
  BIN2 = featureBinary(seq,aaClass("aaE"))
}

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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