getCompScores(BioNet)
getCompScores()所属R语言包:BioNet
Partition scores for subgraphs of the network
网络子图分割分数
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function partitions the scores into scores for each subgraph of the network.
功能分区的分数为每个子网络的分数。
用法----------Usage----------
getCompScores(network, score)
参数----------Arguments----------
参数:network
A network in graphNEL or igraph format.
在graphNEL或IGRAPH格式网络。
参数:score
Vector of scores.
得分向量。
值----------Value----------
A data frame with the components of the network and the score for each PPI identifier.
与网络的组件和得分为每个PPI标识符的数据框。
作者(S)----------Author(s)----------
Marcus Dittrich
举例----------Examples----------
library(DLBCL)
data(interactome)
data(dataLym)
# create random subgraph with 100 nodes and their direct neighbors[创建100个节点和他们的直接邻国的随机子]
nodes <- nodes(interactome)[sample(length(nodes(interactome)), 100)]
subnet <- subNetwork(nodeList=nodes, network=interactome, neighbors="first")
score <- dataLym$score001
names(score) <- dataLym$label
getCompScores(score=score, network=subnet)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|