R语言 BioNet包 fitBumModel()函数中文帮助文档(中英文对照)

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fitBumModel(BioNet)
fitBumModel()所属R语言包：BioNet

                                         Fit beta-uniform mixture model to a p-value distribution
                                         适合β-均匀混合模型的p值分布

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function fits a beta-uniform mixture model to a given p-value distribution. The BUM method was introduced by Stan Pounds and Steve Morris to model the p-value distribution as a signal-noise decompostion. The signal component is assumed to be B(a,1)-distributed,  whereas the noise component is uniform-distributed under the null hypothesis.
该功能适合β-均匀混合模型到一个给定的p值分布。流浪汉方法斯坦英镑和史蒂夫·莫里斯介绍了作为噪声信号分解的p值分布建模。信号组件被认为是的B（a，1）分布，而噪声成分是均匀分布的假设下。


用法----------Usage----------


fitBumModel(x, plot = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：x
Numeric vector of p-values.  
数字矢量p值。


参数：plot
Boolean value, whether to plot a histogram and qqplot of the p-values with the fitted model.  
布尔值，是否绘制直方图和qqplot拟合模型的p值。


值----------Value----------

Maximum likelihood estimator object for the fitted bum model. List of class fb with the following elements:
最大似然估计的拟合烧伤模型对象。 FB类名单包含下列元素：


参数：lambda
Fitted parameter lambda for the beta-uniform mixture model.
β-均匀混合模型的拟合参数的lambda。


参数：a
Fitted parameter a for the beta-uniform mixture model.
拟合参数为β-均匀混合模型。


参数：negLL
Negative log-likelihood.
负面记录的可能性。


参数：pvalues
P-value vector.
P-值向量。


作者（S）----------Author(s)----------



Daniela Beisser




参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


data(pvaluesExample)
pvals <- pvaluesExample[,1]
bum.mle <- fitBumModel(pvals, plot=TRUE)
bum.mle

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