R语言 biomaRt包 getLDS()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getLDS(biomaRt)
getLDS()所属R语言包：biomaRt

                                        Retrieves information from two linked datasets
                                         从两个相连的数据集检索信息

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function is the main biomaRt query function that links 2 datasets and retrieves information from these linked BioMart datasets.  In Ensembl this translates to homology mapping.
此功能是的主要biomaRt查询功能链接2集和检索信息从这些的联系BioMart集。这相当于在Ensembl的同源映射。


用法----------Usage----------


getLDS(attributes, filters = "", values = "", mart, attributesL, filtersL = "", valuesL = "", martL, verbose = FALSE, uniqueRows = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：attributes
Attributes you want to retrieve of primary dataset.  A possible list of attributes can be retrieved using the function listAttributes.
属性，你要检索的主要集。可能的属性列表可以检索使用功能listAttributes。


参数：filters
Filters that should be used in the query. These filters will be applied to primary dataset.  A possible list of filters can be retrieved using the function listFilters.
应在查询中使用的过滤器。这些过滤器将被应用到主数据集。可能的过滤器列表可以检索使用功能listFilters。


参数：values
Values of the filter, e.g. list of affy IDs
过滤器的值，例如affy标识列表


参数：mart
object of class Mart created with the useMart function.
沃尔玛类的对象创建与useMart功能。


参数：attributesL
Attributes of linked dataset that needs to be retrieved
联集的属性，需要检索


参数：filtersL
Filters to be applied to the linked dataset
过滤器被应用到链接的数据集


参数：valuesL
Values for the linked dataset filters
值的连接的数据集过滤器


参数：martL
Mart object representing linked dataset
沃尔玛对象代表联集


参数：verbose
When using biomaRt in webservice mode and setting verbose to TRUE, the XML query to the webservice will be printed.  Alternatively in MySQL mode the MySQL query will be printed.
当使用Web服务模式biomaRt和详细设置为TRUE，XML查询到WebService将被打印。 MySQL查询或者在MySQL模式将被打印。


参数：uniqueRows
Logical to indicate if the BioMart web service should return unique rows only or not.  Has the value of either TRUE or FALSE
顺理成章地表明，如果的BioMart Web服务应该只返回独特的行或不。具有值TRUE或FALSE


作者（S）----------Author(s)----------


Steffen Durinck



举例----------Examples----------


if(interactive()){
human = useMart("ensembl", dataset = "hsapiens_gene_ensembl")
mouse = useMart("ensembl", dataset = "mmusculus_gene_ensembl")
getLDS(attributes = c("hgnc_symbol","chromosome_name", "start_position"), filters = "hgnc_symbol", values = "TP53", mart = human, attributesL = c("chromosome_name","start_position"), martL = mouse)
}

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