exportFASTA(biomaRt)
exportFASTA()所属R语言包:biomaRt
Exports getSequence results to FASTA format
出口某个getSequence结果FASTA格式
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Exports getSequence results to FASTA format
出口某个getSequence结果FASTA格式
用法----------Usage----------
exportFASTA(sequences, file)
参数----------Arguments----------
参数:sequences
A data.frame that was the output of the getSequence function
是的某个getSequence函数的输出数据框
参数:file
File to which you want to write the data
文件您想要将数据写入
作者(S)----------Author(s)----------
Steffen Durinck
举例----------Examples----------
if(interactive()){
mart <- useMart("ensembl", dataset="hsapiens_gene_ensembl")
#seq<-getSequence(chromosome=c(2,2),start=c(100000,30000),end=c(100300,30500),mart=mart)[SEQ <方式某个getSequence(染色体= C(2,2),开始= C(100000,30000),结束= C(100300,30500),集市集市)]
#exportFASTA(seq,file="test.fasta")[exportFASTA(SEQ,文件“test.fasta”的)]
martDisconnect(mart = mart)
}
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注:
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