R语言 BGmix包 plotPredChecks()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotPredChecks(BGmix)
plotPredChecks()所属R语言包：BGmix

                                         Plots of predictive checks for mixture prior.
                                         图之前预测混合物检查。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Histograms and q-q plots of predictive p-values for the mixture prior. Separate plots are given for each mixture component, using only genes with high posterior probability of being classified into the relevant component.
预测混合物的p值前直方图和QQ图。每个混合组件单独图，只用高被分类到相关组件后验概率的基因。


用法----------Usage----------


plotPredChecks(pvals, pc, probz = 0.8, label = "", breaks = 20)



参数----------Arguments----------

参数：pvals
matrix of predictive p-values output by 'ccPred' (NB, not the whole list object, just the matrix of p-values)
预测p-值输出矩阵ccPred（NB的，而不是整个列表中的对象，只是p值矩阵）


参数：pc
matrix of posterior classification probabilities output by 'ccParams' (NB, not the whole list object, just the matrix of probabilities)
“ccParams”（注，而不是整个列表中的对象，只是概率矩阵后分类概率输出的矩阵）


参数：probz
threshold on posterior probabilities for including genes in each mixture component plot
后验概率在每个混合组成部分图，包括基因的阈值


参数：label
title used on histograms
直方图上使用的标题


参数：breaks
argument input to histogram
参数输入到直方图


作者（S）----------Author(s)----------


Alex Lewin



举例----------Examples----------


## Note this is a very short MCMC run![＃注意：这是一个很短的MCMC运行！]
## For good analysis need proper burn-in period.[＃为了获得良好的分析，需要适当的老化期。]
data(ybar,ss)
outdir <- BGmix(ybar, ss, c(8,8), nburn=0, niter=100, nthin=1)
params <- ccParams(outdir)
pred <- ccPred(outdir)
plotPredChecks(pred$pval.ybar.mix2,params$pc,probz=0.5)

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注：
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