plotFDR(BGmix)
plotFDR()所属R语言包：BGmix
Plot estimated FDR etc. for BGmix output.
图，估计BGmix输出FDR等。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a threshold on the posterior probabilities, genes are declared as null or differentially expressed. For any given threshold, the FDR (false discovery rate) and FNR (false non-discovery rate) can be estimated using the posterior probabilities. This function plots these quantities twice, once versus the threshold probabilities, and once versus the number of declared positives.
鉴于上的后验概率的阈值，基因被宣布为空或差异表达。 FDR（错误发现率）和FNR（假非发现率）对于任何给定的阈值，可以使用后验概率估计。此功能图数量的两倍，一旦与阈值的概率，而一旦与声明阳性。
用法----------Usage----------
plotFDR(res, ylim = NULL, q.plotfnr = F, q.plotpcut = T, q.plotnpos = T, ...)
参数----------Arguments----------
参数：res
list object output from 'calcFDR'
列表对象输出从calcFDR
参数：ylim
optional argument specifying limit for y-axis
可选的参数指定限额为y轴
参数：q.plotfnr
Include FNR in plots?
包括在图的FNR？
参数：q.plotpcut
Include the plot of error rates v. threshold on posterior probabilites?
包括错误率诉后probabilites阈值的图吗？
参数：q.plotnpos
Include the plot of error rates v. no. positives.
包括错误率诉没有的图。阳性。
参数：...
arguments passed to 'plot'
参数传递的图“
值----------Value----------
No value is returned to R. Results from BGmix model are output to files.
没有返回值从BGmix模型R.的结果输出到文件。
作者（S）----------Author(s)----------
Alex Lewin
举例----------Examples----------
## Note this is a very short MCMC run![＃注意：这是一个很短的MCMC运行！]
## For good analysis need proper burn-in period.[＃为了获得良好的分析，需要适当的老化期。]
data(ybar,ss)
outdir <- BGmix(ybar, ss, c(8,8), nburn=0, niter=100, nthin=1)
params <- ccParams(outdir)
fdr <- calcFDR(params)
par(mfrow=c(1,2))
plotFDR(fdr)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-25 13:13:43
