R语言 BGmix包 FDRplotTailPP()函数中文帮助文档(中英文对照)

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FDRplotTailPP(BGmix)
FDRplotTailPP()所属R语言包：BGmix

                                        Plot of FDR for tail posterior probability
                                         尾巴的后验概率FDR的图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots smoothed FDR vs tail posterior probability or vs the number of differentially expressed (DE) genes
图平滑FDR与尾部的后验概率或VS（DE）的差异表达的基因数目


用法----------Usage----------


FDRplotTailPP(tpp.res, nmax = sum(! is.na(tpp.res$FDR)), plot.TP = F)



参数----------Arguments----------

参数：tpp.res
output of TailPP
输出的TailPP


参数：nmax
maximum size of the list of DE genes
DE的基因名单的最大尺寸


参数：plot.TP
logical. If TRUE FDR is plotted, otherwise the number of false positives is plotted vs the number of differentially expressed genes
逻辑。如果是TRUEFDR绘制，否则误报数量绘制与差异表达的基因数目


作者（S）----------Author(s)----------


Natalia Bochkina



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

TailPP, histTailPP,EstimatePi0
TailPP，histTailPP，EstimatePi0


举例----------Examples----------




data(ybar, ss)
nreps <- c(8,8)

## Note this is a very short MCMC run![＃注意：这是一个很短的MCMC运行！]
## For good analysis need proper burn-in period.[＃为了获得良好的分析，需要适当的老化期。]
outdir <- BGmix(ybar, ss, nreps, jstar=-1, nburn=0, niter=100, nthin=1)

params <- ccParams(outdir)  
res <-  ccTrace(outdir)
  
tpp.res <- TailPP(res, nreps, params, plots  = FALSE)
FDRplotTailPP(tpp.res, plot.TP = TRUE)



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