R语言 BGmix包 ccSummary()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

ccSummary(BGmix)
ccSummary()所属R语言包：BGmix

                                        Read summary of BGmix output
                                         阅读摘要BGmix输出

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads the summary.txt file output by BGmix, containing information about data sets used and model options. This function is called by ccParams, ccTrace and ccPred, therefore users will not in general need to call it directly.
由BGmix读取Summary.txt文件输出设置使用和模型选项，其中包含有关数据信息。此功能称为，由ccParams，ccTrace和ccPred，因此用户将无法在一般需要直接调用它。


用法----------Usage----------


ccSummary(filedir)



参数----------Arguments----------

参数：filedir
character. The name of the output directory created by BGmix.
字符。由BGmix创建输出目录的名称。


值----------Value----------

A list of scalar values, as follows:
标值的列表，如下：


参数：ngenes,nconds,neffects,ncomps,ntau
nos. genes, conditions, effects, mixture components, gene variances
NOS。基因，条件，效果，混合元件，基因变异


参数：jstar
label of effect with mixture prior (labels start at 0)
标签（标签从0开始）与混合前的效果

model choice options (see BGmix help for details
模式选择选项（见BGmix细节帮助

inital values for eta and lambda (parameters of mixture components)
ETA和lambda>初始值（混合元件的参数）


作者（S）----------Author(s)----------


Alex Lewin



举例----------Examples----------


## Note this is a very short MCMC run![＃注意：这是一个很短的MCMC运行！]
## For good analysis need proper burn-in period.[＃为了获得良好的分析，需要适当的老化期。]
data(ybar,ss)
outdir <- BGmix(ybar, ss, c(8,8), nburn=0, niter=100, nthin=1)
summ <- ccSummary(outdir)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。