R语言 bgafun包 add_pseudo_counts()函数中文帮助文档(中英文对照)

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add_pseudo_counts(bgafun)
add_pseudo_counts()所属R语言包：bgafun

                                         Add pseudo counts to amino acid matrix based on defined groups
                                         根据定义的组的氨基酸矩阵的伪计数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function will add pseudo counts to binary amino acid matrix based on the defined groups. It is used to minimise the effect of small sample size. The method of Henikoff and Henikoff is used to calculate the pseudocounts An alternative method is to simply add 1 to the binary matrix
此功能将二进制氨基酸矩阵的基础上定义的组添加伪计数。它是用于小样本大小的影响减至最低。 Henikoff和Henikoff方法用于计算pseudocounts另一种方法是简单地加1的二进制矩阵


用法----------Usage----------


add_pseudo_counts(amino,groups)



参数----------Arguments----------

参数：amino
Matrix representation of alignment generated by convert\_aln\_amino  
矩阵表示对齐转换\ _aln \ _amino


参数：groups
Vector or factor that shows the group representation for each sequence in the alignment
向量或因素，显示在每个序列组表示对齐


举例----------Examples----------


library(bgafun)
data(LDH.amino.gapless)
data(LDH.groups)
LDH.pseudo=LDH.amino.gapless+1
#or use the function [或使用功能]
LDH.pseudo=add_pseudo_counts(LDH.amino.gapless,LDH.groups)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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