R语言 spider包 chaoHaplo()函数中文帮助文档(中英文对照)

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chaoHaplo(spider)
chaoHaplo()所属R语言包：spider

                                         Chao estimator of haplotype number
                                         潮估计单倍型数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculates the Chao1 estimate of the number of haplotypes in a population based on the total number of haplotypes present, and the number of singletons and doubletons in the dataset.
计算超1单倍型的数量在人口总数的单倍型目前的基础上，估计的数量单身人士和doubletons的数据集。


用法----------Usage----------


chaoHaplo(DNAbin)



参数----------Arguments----------

参数：DNAbin
An object of class "DNAbin".  
对象类的DNAbin。


Details

详细信息----------Details----------

The function assumes a large number of specimens have been sampled and that duplicate haplotypes have not been removed. Interpretation becomes difficult when more than one species is included in the dataset.
的功能，承担了大量的标本进行了采样，并没有被去除重复的单倍型。当一个以上的物种被列入数据集的解释变得困难。


值----------Value----------

An integer giving the estimated total number of haplotypes in the population.
一个整数，单倍型的人口估计总数。


（作者）----------Author(s)----------



Samuel Brown <s_d_j_brown@hotmail.com>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

haploAccum
haploAccum


实例----------Examples----------


data(dolomedes)
#Create dataset with multiple copies of Dolomedes haplotypes[创建数据集的多个副本Dolomedes单倍型]
doloSamp <- dolomedes[sample(16, 100, replace=TRUE, prob=c(0.85, rep(0.01, 15))), ]

chaoHaplo(doloSamp)


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