R语言 beadarray包 outlierplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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outlierplot(beadarray)
outlierplot()所属R语言包：beadarray

                                       
                                         

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to plot where the outliers are located on a given array
离群的地方位于一个给定的数组函数进行绘图


用法----------Usage----------


outlierplot(BLData, array = array, transFun = logGreenChannelTransform, outlierFun = illuminaOutlierMethod,n=3, wtsname=NULL, horizontal = TRUE, nSegments = NULL, lowOutlierCol = "blue", highOutlierCol = "pink", outlierPch = ".", main = "", ...)



参数----------Arguments----------

参数：BLData
a beadLevelData object  
beadLevelData对象


参数：array
the number of the array to plot  
图阵列的数目


参数：transFun
a function defining how to transform the data prior to calculating outliers  
定义一个函数如何转换数据之前计算离群


参数：outlierFun
function that will identify outliers  
功能，将确定离群


参数：n
an indicator of how extreme an observation must be (e.g. how many MADs from the median), to be passed to the function that will identify outliers
观察必须是极端的指标（如多少位数的MADS），被传递到的功能，将确定离群


参数：wtsname
column name of BLData object containing weights to feed to the outlier function  
BLData对象的列名包含重喂离群值函数


参数：horizontal
if TRUE the longest edge of the array section will be on the x axis  
数组段最长的边缘，如果为TRUE将在x轴


参数：nSegments
How many segments the section is divided into. If this argument is left as the default value (NULL) the code will attempt to extract this information from the relevant .sdf file.  If it can't be found then the segments will not be indicated on the final plot.  
部分被分为多少段。如果此参数为默认值（NULL）离开代码将尝试从有关。sdf文件中提取这些信息。如果它不能被发现，然后分部将不会被显示在最后的图。


参数：lowOutlierCol
what colour to plot outliers below the median  
什么颜色的图离群值低于中位数


参数：highOutlierCol
what colour to plot outliers above the median  
什么颜色的图离群值高于中位数


参数：outlierPch
plotting character for the outliers  
绘制离群的性格


参数：main
an optional title for the plot  
图可选的标题


参数：...
additional arguments  
额外的参数


Details

详情----------Details----------

The function calls the specified outlier function to determine the outliers on the array and then plots their location. Points are coloured according the intensity of the bead is above or below the median for that bead-type.
函数调用指定的离群功能，以确定阵列上的离群值，然后图谋自己的位置。点的颜色根据珠的强度是高于或低于中位数，珠型。


值----------Value----------

plot produced on current graphical device
对当前的图形设备生产的图


作者（S）----------Author(s)----------



Mark Dunning and Mike Smith




举例----------Examples----------



if(require(beadarrayExampleData)){

data(exampleBLData)
outlierplot(exampleBLData, array=1, horizontal = FALSE)


}


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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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