sp.mantel.mc(spdep)
sp.mantel.mc()所属R语言包:spdep
Mantel-Hubert spatial general cross product statistic
曼特尔-Hubert的空间一般的交叉产品统计
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A permutation test for the spatial general cross product statistic with Moran (C(i,j) = z(i)*z(j)), Geary (C(i,j) = (z(i) - z(j))^2), and Sokal (C(i,j) = |z(i) - z(j)|) criteria, for z(i) = (x(i) - mean(x))/sd(x). plot.mc.sim is a helper function to plot the outcomes of the permutation test.
置换试验的空间统计与一般的交叉产品莫兰(C(i,j) = z(i)*z(j)),基尔(C(i,j) = (z(i) - z(j))^2),以及索卡尔(C(i,j) = |z(i) - z(j)|)的标准,z(i) = (x(i) - mean(x))/sd(x)。 plot.mc.sim是一个辅助函数来绘制的置换测试的结果。
用法----------Usage----------
sp.mantel.mc(var, listw, nsim, type = "moran", zero.policy = NULL,
alternative = "greater", spChk=NULL, return_boot=FALSE)
## S3 method for class 'mc.sim'
plot(x, xlim, xlab, main, sub, ..., ptype="density")
参数----------Arguments----------
参数:var
a numeric vector the same length as the neighbours list in listw
一个数值向量相同的长度的邻居列表中listw
参数:listw
a listw object created for example by nb2listw
例如创建一个listw对象的nb2listw
参数:nsim
number of permutations
的排列数
参数:type
"moran", "geary" or "sokal" criteria for similarity
“莫兰”,“吉里”或“索卡尔的相似性”的标准
参数:zero.policy
default NULL, use global option value; if TRUE assign zero to the lagged value of zones without neighbours, if FALSE assign NA
默认为空,请使用全局选项的值,如果真没有邻居的滞后值的区域分配了零,如果为FALSE分配NA
参数:alternative
a character string specifying the alternative hypothesis, must be one of "greater" (default), or "less".
一个字符串,指定其他假设,必须是一个“大”(默认),或“少”。
参数:spChk
should the data vector names be checked against the spatial objects for identity integrity, TRUE, or FALSE, default NULL to use get.spChkOption()
应的数据向量空间对象的名称进行核对身份完整性,TRUE,否则返回FALSE,默认为空,使用get.spChkOption()
参数:return_boot
return an object of class boot from the equivalent permutation bootstrap rather than an object of class htest
返回类的boot的等效置换引导,而不是一个对象类htest的对象
参数:x
the object to be plotted
该对象被绘制
参数:xlim
the range of the x axis
的范围内的x轴
参数:xlab
a title for the x axis
一个标题为x轴
参数:main
an overall title for the plot
总冠军的图
参数:sub
a sub title for the plot
一个子标题为图
参数:ptype
either "density" or "hist"
无论是“密度”或“历史”
参数:...
further arguments passed through
通过进一步的论据
值----------Value----------
A list with class htest and mc.sim containing the following components:
列表类htest和mc.sim包含以下组件:
参数:statistic
the value of the observed Geary's C.
Geary的C.观察到的值
参数:parameter
the rank of the observed Geary's C.
排名所观察到的Geary的C.
参数:alternative
a character string describing the alternative hypothesis.
一个字符串,描述了另一种假设。
参数:method
a character string giving the method used.
一个字符串提供的方法使用。
参数:data.name
a character string giving the name(s) of the data, and the number of simulations.
一个字符的字符串,给出的名称(s)的数据,并将模拟数量。
参数:p.value
the pseudo p-value of the test.
伪p值的测试。
参数:res
nsim simulated values of statistic, final value is observed statistic
NSIM模拟的统计值,终值的观察统计
参数:estimate
the mean and variance of the simulated distribution.
模拟分布的均值和方差。
(作者)----------Author(s)----------
Roger Bivand <a href="mailto:Roger.Bivand@nhh.no">Roger.Bivand@nhh.no</a>
参考文献----------References----------
Haining, R. 1990 Spatial data analysis in the social and environmental sciences, Cambridge: Cambridge University Press, p. 230–1. The function has been checked against general matrix code posted to the r-help list by Ben Bolker on 1 May 2001; another <code>mantel()</code> function
参见----------See Also----------
moran.mc, joincount.mc,
moran.mc,joincount.mc,
实例----------Examples----------
data(oldcol)
sim1 <- sp.mantel.mc(COL.OLD$CRIME, nb2listw(COL.nb),
nsim=99, type="geary", alternative="less")
sim1
plot(sim1)
sp.mantel.mc(COL.OLD$CRIME, nb2listw(COL.nb), nsim=99,
type="sokal", alternative="less")
sp.mantel.mc(COL.OLD$CRIME, nb2listw(COL.nb), nsim=99,
type="moran")
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