R语言 beadarray包 beadIntensityPlots()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

beadIntensityPlots(beadarray)
beadIntensityPlots()所属R语言包：beadarray

                                         Plotting the intensities of selected beads on a section
                                         一节上绘制选定珠的强度

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function will plot the intensities of selected beads on a specified array
函数将绘制在指定的阵列选定珠的强度


用法----------Usage----------


plotBeadIntensities(BLData, array = 1, BeadIDs, transFun = logGreenChannelTransform, cols = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：BLData
a beadLevelData object  
beadLevelData对象


参数：array
numeric specifying which array to plot the intensities from  
数字指定数组绘制的强度


参数：BeadIDs
what ArrayAddress IDs to be plotted  
什么ArrayAddress ID来绘制


参数：transFun
function specifying what transformation to be applied to the beadLevelData prior to plotting   
功能指定什么改造被应用到beadLevelData前策划


参数：cols
a vector of colours to be used to plot each ID. If NULL the rainbow function is used to generate colours.  
要使用的颜色向量绘制每个ID。如果为NULL rainbow函数用来生成颜色。


参数：...
other argument that may be passed along to plot.  
其他参数，可以传递给小区。


Details

详情----------Details----------

The function will take all data from the specified section, apply the transformation (the default is to do log2) and then find the subset of beads that have the specified ID. These IDs should match the numeric ArrayAddress IDs that are stored in the beadLevelData object.
函数将采取从指定的节中的所有数据，应用转换（默认是做的log2），然后找到具有指定ID的珠子集。这些标识应符合的数字ArrayAddress在存储的beadLevelData对象的标识。


值----------Value----------

Plot is produced on current graphical device.
图当前图形设备的生产。


作者（S）----------Author(s)----------



Mark Dunning




举例----------Examples----------



if(require(beadarrayExampleData)){


data(exampleBLData)

randIDs = sample(getBeadData(exampleBLData, array=1, what="ProbeID"),10)

plotBeadIntensities(exampleBLData, array=1, BeadIDs = randIDs)

}



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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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