R语言 beadarraySNP包 standardNormalization()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

standardNormalization(beadarraySNP)
standardNormalization()所属R语言包：beadarraySNP

                                        Default complete normalization
                                         默认的完全标准化

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Performs all steps in normalization at best settings as determined in ref.
在最好的文献确定的设置执行所有步骤的标准化。


用法----------Usage----------


standardNormalization(snpdata)



参数----------Arguments----------

参数：snpdata
SnpSetIllumina object with raw data
SnpSetIllumina对象与原始数据


Details

详情----------Details----------

The function performs in the following steps snpdata<-normalizeBetweenAlleles.SNP(snpdata)<br> snpdata<-normalizeWithinArrays.SNP(snpdata,callscore = 0.8, relative = TRUE, fixed = FALSE, quantilepersample = TRUE)<br> snpdata<-normalizeLoci.SNP(snpdata,normalizeTo = 2)
该函数执行snpdata<-normalizeBetweenAlleles.SNP(snpdata)参考snpdata<-normalizeWithinArrays.SNP(snpdata,callscore = 0.8, relative = TRUE, fixed = FALSE, quantilepersample = TRUE)参考snpdata<-normalizeLoci.SNP(snpdata,normalizeTo = 2)以下步骤


值----------Value----------

A SnpSetIllumina object with the G, R and intensity elements in  assayData normalized to obtain values close to 2 on a linear scale for  unaffected material.
一个SnpSetIllumina归获得上不受影响材料的线性度值接近2 G, R and intensity在assayData元素的对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Jan Oosting



参见----------See Also----------

normalizeBetweenAlleles.SNP,normalizeWithinArrays.SNP,
normalizeBetweenAlleles.SNP，normalizeWithinArrays.SNP


举例----------Examples----------


  data(chr17.260)
  data.nrm<-standardNormalization(chr17.260)

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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