R语言 beadarraySNP包 QCIllumina-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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QCIllumina-class(beadarraySNP)
QCIllumina-class()所属R语言包：beadarraySNP

                                        Class "QCIllumina"
                                         类“QCIllumina”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Container of QC information on arrays that contain multiple samples.
阵列包含多个样品的质量控制信息的容器。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("QCIllumina", arrayType, arrayID,  intensityMed, greenMed, redMed, intensityMode, greenMode, redMode, validn, annotation,  samples), but are usually created by calculateQCarray.
可以通过检测的形式new("QCIllumina", arrayType, arrayID,  intensityMed, greenMed, redMed, intensityMode, greenMode, redMode, validn, annotation,  samples)创建对象，但通常是由calculateQCarray创建。


插槽----------Slots----------




arrayType: character, Type of array. See  arrayType
arrayType：字符，数组类型。看到arrayType




arrayID: character, Array ID
arrayID：字符，数组ID




intensityMed: numeric matrix, Median of intensity of samples
intensityMed：数字矩阵，样本中位数强度




greenMed: numeric matrix, Median of green values
greenMed：数字矩阵，绿色值的中位数




redMed: numeric matrix, Median of red values
redMed：数字矩阵，红色值的中位数




callrate: numeric matrix, callrate of genotyping
callrate：数字矩阵，基因分型callrate




hetPerc: numeric matrix, Percentage of heterozygotes
hetPerc：数字矩阵，杂合子的百分比




ptpdiff: numeric matrix, point-to-point difference, local estimate of variability
ptpdiff：数字矩阵，点至点的差异，当地估计的变异




validn: numeric matrix, Number of valid probe values in samples
validn：数字矩阵，有效探测值的样本数




annotation: character matrix, Annotation of samples
annotation：字符点阵，样品的诠释




samples: character matrix, Sample IDs
samples：字符点阵，样品ID


方法----------Methods----------




arrayID signature(object = "QCIllumina"): Returns type of array
arrayIDsignature(object = "QCIllumina")：返回数组类型




arrayID<- signature(object = "QCIllumina"): Sets type of array.
arrayID < - signature(object = "QCIllumina")：设置数组类型。




arrayType signature(object = "QCIllumina"): Returns ID of array
arrayType的signature(object = "QCIllumina")：返回数组的ID




arrayType<- signature(object = "QCIllumina"): Sets ID/Barcode of array
arrayType的< - signature(object = "QCIllumina")：设置阵列的编号/条码




initialize signature(.Object = "QCIllumina")  
初始化signature(.Object = "QCIllumina")




plotQC signature(object = "QCIllumina")character: plots spatial overview of QC information, type is one of c("intensityMed",
plotQCsignature(object = "QCIllumina")  character：图的空间概述QC信息，type是对<code>&#199;（“intensityMed”


作者（S）----------Author(s)----------


Jan Oosting



参见----------See Also----------

calculateQCarray
calculateQCarray

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。