PolarTransforms(beadarraySNP)
PolarTransforms()所属R语言包:beadarraySNP
Polar transformations
极性转换
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Perform polar transforms on Illumina Golden Gate bead arrays
执行Illumina的金门珠阵列的极性变换
用法----------Usage----------
RG2polar(object,trig=FALSE)
polar2RG(object,trig=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:object
SnpSetIllumina object
SnpSetIllumina对象
参数:trig
Logical, use geometric distance intensity. Otherwise use addition of intensities
逻辑,使用几何距离强度。否则,使用强度除
Details
详情----------Details----------
RG2polar transforms the R and G matrices to theta and intensity matrices. Note that the intensity value is the sum of R and G and not the geometric distance to the origin.
RG2polarR和G矩阵theta和intensity矩阵转换。请注意,强度值是R和G“几何原点的距离的总和。
polar2RG performs the reverse transformation
polar2RG执行反向转换
值----------Value----------
This function returns an SnpSetIllumina object.
此函数返回一个SnpSetIllumina对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Jan Oosting
参见----------See Also----------
SnpSetIllumina-class
SnpSetIllumina-class
举例----------Examples----------
data(chr17.260)
data.polar<-RG2polar(chr17.260)
plot(assayData(data.polar)$theta,assayData(data.polar)$intensity)
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