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R语言 beadarraySNP包 normalizeBetweenAlleles.SNP()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 12:36:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
normalizeBetweenAlleles.SNP(beadarraySNP)
normalizeBetweenAlleles.SNP()所属R语言包:beadarraySNP

                                        between Allele normalization
                                         等位基因标准化之间

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Perform between Allele normalization on Illumina Golden Gate bead arrays
Illumina的金门珠阵列上执行之间的等位基因标准化


用法----------Usage----------


   normalizeBetweenAlleles.SNP(object,method=c("quantile"),subsample="OPA")



参数----------Arguments----------

参数:object
class SnpSetIllumina
类SnpSetIllumina


参数:method
char, type of normalization
char类型的标准化


参数:subsample
factor with length number of features in object or char,column name in featureData slot
factor功能在对象或char,featureData槽列名的长度数


Details

详情----------Details----------

This function performs a quantile normalization between the Red and Green channels for each sample. The rationale for this procedure stems from the fact that the allele frequencies within each channel are always very similar, even in the  presence of genomic abnormalities.
这个函数执行每个样品之间的红色和绿色通道的位数标准化。源于一个事实,每个通道内的等位基因频率总是非常相似,甚至存在基因异常,在此过程中的理由。


值----------Value----------

This function returns an SnpSetIllumina object.
此函数返回一个SnpSetIllumina对象。


作者(S)----------Author(s)----------


Jan Oosting



参见----------See Also----------

SnpSetIllumina-class,normalizeWithinArrays.SNP, backgroundCorrect.SNP
SnpSetIllumina-class,normalizeWithinArrays.SNP,backgroundCorrect.SNP


举例----------Examples----------


data(chr17.260)
data.nrm<-normalizeBetweenAlleles.SNP(chr17.260)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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