AttractorModuleSet-class(attract)
AttractorModuleSet-class()所属R语言包:attract
Class AttractorModuleSet
类AttractorModuleSet
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is a class representation for storing the output of the findAttractors function.
这是一个存储findAttractors函数的输出的类表示。
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects are output by the function findAttractors. Objects can also be created by using new("AttractorModuleSet", ...).
对象是输出功能findAttractors。对象也可以使用new("AttractorModuleSet", ...)创建。
插槽----------Slots----------
eSet: ExpressionSet which primarily stores the expression data and the phenotype/sample data sets.
eSet:ExpressionSet主要存储和表达数据的表型/样本数据集。
cellTypeTag: character string of the tag which stores the group membership information for the samples. Must be a column name of the data frame pData(eset).
cellTypeTag:字符字符串存储为样本组成员信息的标签。必须有一个数据框PDATA(ESET)的列名。
incidenceMatrix: incidence matrix used as input to GSEAlm.
incidenceMatrix:作为输入到GSEAlm使用关联矩阵。
rankedPathways: Data frame of significantly enriched pathways, ranked first by significance and then by size.
rankedPathways:数据框显着丰富的途径,意义,然后按大小排名第一。
方法----------Methods----------
No methods have yet been defined with class "AttractorModuleSet" in the signature.
没有方法尚未被定义类的“AttractorModuleSet”签名。
注意----------Note----------
This class is better describe in the vignette.
这个类是更好的描述中的小插曲。
作者(S)----------Author(s)----------
Jessica Mar <a href="mailto:jess@jimmy.harvard.edu">jess@jimmy.harvard.edu</a>
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
new.attractmodule <- new("AttractorModuleSet", eSet=new("ExpressionSet"), cellTypeTag=character(1), incidenceMatrix=matrix(0), rankedPathways=data.frame())
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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