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R语言 attract包 AttractorModuleSet-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 12:25:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
AttractorModuleSet-class(attract)
AttractorModuleSet-class()所属R语言包:attract

                                        Class AttractorModuleSet
                                         类AttractorModuleSet

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is a class representation for storing the output of the findAttractors function.       
这是一个存储findAttractors函数的输出的类表示。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects are output by the function findAttractors.  Objects can also be created by using new("AttractorModuleSet", ...).
对象是输出功能findAttractors。对象也可以使用new("AttractorModuleSet", ...)创建。


插槽----------Slots----------




eSet:  ExpressionSet which primarily stores the expression data and the phenotype/sample data sets.
eSet:ExpressionSet主要存储和表达数据的表型/样本数据集。




cellTypeTag:  character string of the tag which stores the group membership information for the samples. Must be a column name of the data frame pData(eset).
cellTypeTag:字符字符串存储为样本组成员信息的标签。必须有一个数据框PDATA(ESET)的列名。




incidenceMatrix:  incidence matrix used as input to GSEAlm.
incidenceMatrix:作为输入到GSEAlm使用关联矩阵。




rankedPathways:  Data frame of significantly enriched pathways, ranked first by significance and then by size.
rankedPathways:数据框显着丰富的途径,意义,然后按大小排名第一。


方法----------Methods----------

No methods have yet been defined with class "AttractorModuleSet" in the signature.
没有方法尚未被定义类的“AttractorModuleSet”签名。


注意----------Note----------

This class is better describe in the vignette.
这个类是更好的描述中的小插曲。


作者(S)----------Author(s)----------


Jessica Mar <a href="mailto:jess@jimmy.harvard.edu">jess@jimmy.harvard.edu</a>



举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
new.attractmodule <- new("AttractorModuleSet", eSet=new("ExpressionSet"), cellTypeTag=character(1), incidenceMatrix=matrix(0), rankedPathways=data.frame())

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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