R语言 spatcounts包 LogLike()函数中文帮助文档(中英文对照)

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LogLike(spatcounts)
LogLike()所属R语言包：spatcounts

                                        Individual log-likelihood
                                         个人对数似然

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

'LogLike' calculates the individual log-likelihood which is needed for 'Clarketest' and 'Vuongtest'.
“LogLike计算个人log这是需要”Clarketest“和”Vuongtest“的可能性。


用法----------Usage----------


LogLike(Yin, fm.X, region, regmodel, thinning = 1, burnin = 1)



参数----------Arguments----------

参数：Yin
response vector of length n.
长度为n的响应矢量。


参数：fm.X
formula for mean design.
平均设计公式。


参数：region
region of each observation.
每个观测区域。


参数：regmodel
the output of model fits obtained by using 'est.sc'.
适合的输出模式得到使用“est.sc”。


参数：thinning
number of MCMC iterations between two writing steps (if thinning=1 (default), all states are calculated whereas if e.g. thinning=10 only each 10 iteration is calculated)
如果细化= 1（默认），所有国家的两个写作步骤（MCMC迭代计算，而如果例如细化为10只，每10迭代计算）


参数：burnin
number of steps dropped from the chain to allow for a burn-in phase. Defaults to 1.
数下降从链的步骤，以允许一个老化阶段。默认为1。


值----------Value----------

<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>ll </td> <td> is a matrix of dimension (n x (totalit+2)), where each  column represents one iteration and contains the likelihood  contributions of each observation.</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> ll </ TD> <TD>是一个矩阵的尺寸（NX（2 totalit）），其中每一列代表一个迭代的可能性，并包含每个观测的贡献。</ TD> </ TR> </表>


实例----------Examples----------


data(sim.Yin)
data(sim.fm.X)
data(sim.region)
data(sim.gmat)
data(sim.nmat)

poi <- est.sc(sim.Yin, ~1+sim.fm.X[,1]+sim.fm.X[,2], sim.region,
model="Poi", sim.gmat, sim.nmat, 3)

ll.poi <- LogLike(sim.Yin, ~1+sim.fm.X[,1]+sim.fm.X[,2], sim.region, poi)

# log likelihood for the single iterations[单次迭代的对数似然]
apply(ll.poi$ll,2,sum)

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