R语言 sparcl包 ColorDendrogram()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ColorDendrogram(sparcl)
ColorDendrogram()所属R语言包：sparcl

                                        Color the leaves in a hierarchical clustering dendrogram
                                         颜色的叶子分层聚类树状图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Pass in the output of "hclust" and a class label for each observation. A colored dendrogram will result, with the leaf colors indicating the classes.
通过在输出“hclust”和对于每个观测一类标签。一种着色的树状图，将导致与叶的颜色表示的类。


用法----------Usage----------


ColorDendrogram(hc, y, main = "", branchlength = 0.7, labels = NULL, xlab = NULL, sub = NULL, ylab = "", cex.main = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：hc
The output of running "hclust" on a nxn dissimilarity matrix
一个NxN相异度矩阵的输出运行的“hclust”


参数：y
A vector of n class labels for the observations that were clustered using "hclust". If labels are numeric from 1 to K, then colors will be determine automatically. Otherwise the labels can take the form of colors (e.g. c("red", "red", "orange", "orange")).
一个矢量的N类标签的意见，聚集使用“hclust”。如果标签数字从1到K，然后颜色会自动确定。否则，标签的颜色可以采取的形式（如c（“红”，“红”，“橙”，“橙”））。


参数：main
The main title for the dendrogram.
树状图的主标题。


参数：branchlength
How long to make the colored part of the branches. Adjustment will be needed for each dissimilarity matrix
多长的树枝，使颜色的部分。调整将需要为每个相异度矩阵


参数：labels
The labels for the n observations.
标签的N个观测值。


参数：xlab
X-axis label.
X-轴的标签。


参数：sub
Sub-x-axis label.
分x轴的标签。


参数：ylab
Y-axis label.
Y-轴的标签。


参数：cex.main
The amount by which to enlarge the main title for the figure.
放大的主标题为数字量。


（作者）----------Author(s)----------


Daniela M. Witten and Robert Tibshirani



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

HierarchicalSparseCluster, HierarchicalSparseCluster.permute
HierarchicalSparseCluster，HierarchicalSparseCluster.permute


实例----------Examples----------


# Generate 2-class data[生成2级数据]
set.seed(1)
x <- matrix(rnorm(100*20),ncol=20)
y <- c(rep(1,50),rep(2,50))
x[y==1,] <- x[y==1,]+2
# Perform hierarchical clustering[执行层次聚类]
hc <- hclust(dist(x),method="complete")
# Plot[图]
ColorDendrogram(hc,y=y,main="My Simulated Data",branchlength=3)

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