preProcessGeneST(ArrayTools)
preProcessGeneST()所属R语言包:ArrayTools
Proprocess genechip ST array
proprocess基因芯片ST阵列
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Proprocess genechip ST array by taking the log2 of the expression value.
proprocess基因芯片ST数组表达式的值的log2。
用法----------Usage----------
preProcessGeneST(object, offset = 1, rmControl = TRUE, output = FALSE, mydir = getwd())
参数----------Arguments----------
参数:object
an ExpressionSet.
ExpressionSet。
参数:offset
The offset is added to the expression value to avoid log2(0) = -Inf.
offset添加到表达式的值,以避免为log2(0)=-INF。
参数:rmControl
Setting rmControl = TRUE to remove control probes.
设置rmControl = TRUE删除控制探针。
参数:output
If output = TRUE, it will output the preprocessed data in the specified direcotry from the mydir argument.
如果output = TRUE,它会从mydir参数在指定direcotry输出预处理后的数据。
参数:mydir
specifed directory to contain the output
specifed目录包含输出
值----------Value----------
an ExpressionSet
ExpressionSet
作者(S)----------Author(s)----------
Xiwei Wu, Arthur Li
举例----------Examples----------
data(eSetExample)
processedData <- preProcessGeneST(eSetExample)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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