plotnetwork(spaa)
plotnetwork()所属R语言包：spaa
Correlation network plot
相关网络图
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function could be used to plot correlation network, with less than 15 sites (recommended). The points lie in a circle with lines connected. Blue lines indicate negative values and the red ones the positive ones.
此功能可用于图相关网络，不到15个站点（推荐）。点在于连接线的圆。蓝线表示负值，红色的，积极的。
用法----------Usage----------
plotnetwork(datainput, interval = 8, xlim = c(-2.5,5),
ylim=c(-3.2,3.2), lty = c(1,2,3,4,4,3,2,1,5), value = "r",
legendx = 3, legendy = 0, right = 1.2, intcept = 0.22,
left = 0.35, linelength = 0.3, cex = 3, lwd = 1.5,
show.legend = TRUE, digits = 2, dit = 1.2,
number.label = TRUE, text.label = TRUE,
linecol = c("red", "black"), ...)
参数----------Arguments----------
参数：datainput
The correlation matrix, ex. Pearson's correlation matrix
相关矩阵前。 Pearson相关性矩阵
参数：interval
Number of intervals of the values, indicating how to partition the range of input data
数的值的间隔，表示如何分割的范围内的输入数据
参数：xlim
The x range of the plot. The users need not to change it.
X系列的图。用户无需去改变它。
参数：ylim
The y range of the plot. The users need not to change it.
y范围的图。用户无需去改变它。
参数：lty
Line styles used in connection lines for each interval. Must have number of elements + 1.
线连接线的每一个区间中使用的样式。必须拥有的元素数+ 1。
参数：value
Value of the matrix, should be a character, will used in legend.
矩阵的价值，应该是一个字符，将用在传说中。
参数：legendx
Legend position x.
传说位置x。
参数：legendy
Legend position y.
图例位置y。
参数：right
Legend position adjustment parameter.
图例位置调整参数。
参数：intcept
Legend position adjustment. can be used to specify the row space between each line for the legend.
图例位置的调整。可用于指定的行的每一行之间的空间中的图例。
参数：left
Legend position adjustment parameter.
图例位置调整参数。
参数：linelength
Line length in the legend.
在传说中的线的长度。
参数：cex
Point size for each circle.
每个圆圈的大小点。
参数：lwd
Line width for each circle.
每圈的线宽。
参数：...
Other arguments to be passed from.
其他参数传递。
参数：show.legend
Whether the legend should be drawn.
是否应该得出的传说。
参数：digits
Number of digits displayed in legend.
传说中显示的数字。
参数：dit
Distance of text labels from each corner.
文本标签从每一个角落的距离。
参数：number.label
Whether the number label should be drawn.
号标签是否应当制定。
参数：text.label
Whether the text label should be drawn.
无论是文本标签应当制定。
参数：linecol
Colors of the lines speciefied. The positive correlation will be drawn in the first color specified.
的线条的颜色speciefied。将绘制在指定的第一种颜色的正相关性。
Details
详细信息----------Details----------
This function could be used to plot connections for less than 20 sites ( above 20 are not recommend since there would be too many connections, and difficult to obtain usefull information).
此功能可用于图连接不到20个站点（20以上不建议，因为有太多的连接，而且很难获得有用的信息）。
The lines will be in red or blue, according to whether the value is positive or negative. Users may specify the line style and legends position depends on their private interests.
这两条线会在红色或蓝色，根据该值是否为正的或负的。用户可以指定的线条样式和传说中的位置取决于在自己的私人利益。
值----------Value----------
Correlation network plots.
相关网络图。
（作者）----------Author(s)----------
Jinlong Zhang <a href="mailto:jinlongzhang01@gmail.com">jinlongzhang01@gmail.com</a>
参考文献----------References----------
None
实例----------Examples----------
data(testdata)
spmatrix <- data2mat(testdata)
result <- sp.pair(spmatrix)
plotnetwork(result$Pearson)
plotnetwork(result$Pearson, linecol = c("orange", "blue"),
number.label = FALSE)
title("Pearson Correlation Network")
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-9-30 12:10:05
