R语言 arrayQuality包 readSpikeTypes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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readSpikeTypes(arrayQuality)
readSpikeTypes()所属R语言包：arrayQuality

                                        Read Spike Types File
                                         阅读穗型文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read a table containing information about the doping control mixture used in the hybridization.
读表，其中包含有关使用兴奋剂控制在杂交混合物的信息。


用法----------Usage----------


readSpikeTypes(file = "DopingTypeFile2.txt", path = NULL, cy5col = "MassCy5", cy3col = "MassCy3", ...)



参数----------Arguments----------

参数：file
A "character" string giving the name of the file specifying the doping controls used.
一个“字符”字符串给指定使用的兴奋剂控制的文件的名称。


参数：path
A "character" string giving the directory containing the file. By default this is set to the current working directory (".").
一个“字符”字符串，给出包含该文件的目录。默认情况下，这是设置为当前工作目录（“。”）。


参数：cy5col
A "character" string describing the name of the column corresponding to the controls labelled with Cy5.
一个“字符”描述用Cy5标记的控件对应的列名的字符串。


参数：cy3col
A "character" string describing the name of the column corresponding to the controls labelled with Cy3.
一个“字符”描述用Cy3标记的控件对应的列名的字符串。


参数：...
Additional arguments passed to "readSpotTypes"
额外的参数传递“readSpotTypes”


Details

详情----------Details----------

The file is a text file with rows corresponding to doping controls and columns describing various experimental conditions. It must contain an oligo sequence identifier for each control, the spike type (e.g. Ambion or MJ) and the mass of each oligo spiked in each channel. By default, this function assumes that the mass unit are the same.
该文件是一个文本文件与相应的兴奋剂控制和列描述了各种实验条件的行。它必须为每个控件包含一个寡核苷酸序列标识符，穗型（如Ambion公司或MJ）和大众飙升每个通道中的每个寡。此功能默认情况下，假设单位质量是相同的。


值----------Value----------

A list of n matrices, each matrix containing information about a unique type of spiked controls.  
一个n矩阵，每个矩阵包含独特的尖刺控制类型的信息。


作者（S）----------Author(s)----------


Agnes Paquet



举例----------Examples----------


datadir <- system.file("Meebo", package="arrayQuality")
if (interactive())
{
spikes <-
readSpikeTypes(file="StanfordDCV1.7complete.txt",path=datadir,cy5col="CY5.ng._MjDC_V1.7",cy3col="CY3.ng._MjDC_V1.7")
}

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