R语言 arrayQuality包 PRv9mers()函数中文帮助文档(中英文对照)

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PRv9mers(arrayQuality)
PRv9mers()所属R语言包：arrayQuality

                                        Print Run Quality version 9mers
                                         打印运行质量版本9mers的

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Qualitative diagnostic plots looking at print-run quality.  This component examine the 9mers hybridizations.
定性诊断图寻找在印数品质。此组件检查9mers杂交。


用法----------Usage----------


PRv9mers(fnames, path = ".", dev = "png", DEBUG = FALSE, prargs = NULL, samepr = TRUE, prname = "xMm", save = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：fnames
A "character" string naming the input files.
一个“字符”字符串，命名输入文件。


参数：path
A "character" string representing the data directory. By default this is set to the current working directory (".").
一个“字符”字符串表示的数据目录。默认情况下，这是设置为当前工作目录（“。”）。


参数：dev
A "character" string naming the graphics device. This will take arguments "png", "jpeg" and "ps" only.
一个“字符”字符串命名的图形设备。这将带参数的“PNG”，“JPEG”和“PS”只。


参数：DEBUG
If 'TRUE', debug statements are printed.
如果“TRUE”，打印调试语句。


参数：prargs
A list with 4 components: Block, Row, Column and ncolumns. See Details for more information.
4组件的列表：座，行，列和ncolumns。更多信息，请参阅。


参数：samepr
If 'TRUE', we assume everything in the directory are from the same print-run.
如果“TRUE”，我们假设目录中的一切都从相同的印数。


参数：prname
A "character" string giving the name of the print-run.
一个“字符”印数名称的字符串。


参数：save
If "TRUE", the figures will be saved to files.
如果“TRUE”，数字将被保存到文件。


参数：...
additional arguments
额外的参数


Details

详情----------Details----------

The argument "prargs" is used to calculate the layout information about a print-run.  Components Block, Row and Columns denote the column names from the input data representing the print-tip location. The component "ncolumns" is an integer representing the number of print-tip columns in the data.  If the argument is set to NULL, the the following default will be used:  list(Block="Block", Row="Row", Column="Column", ncolumns=4).
参数“prargs”被用来计算约印数布局信息。组件块，行和列表示代表打印头的位置，从输入数据中的列名。组件“ncolumns”是一个整数，代表打印头中的数据列的数量。如果参数设置为NULL，以下默认将使用列表（座=“块”，行=“行”，“列”列“，ncolumns = 4）。


值----------Value----------

Files of diagnostic plots and  excel files containings probe IDs of problematic probes.
诊断图的文件和Excel文件containings探讨问题的探针的ID。


作者（S）----------Author(s)----------


Jean Yee Hwa Yang



举例----------Examples----------


datadir <- system.file("gprQCData", package="arrayQuality")
if (interactive())
PRv9mers(fnames="12Mm250.gpr", path=datadir, prname="12Mm")

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