R语言 aroma.light包 sampleCorrelations.matrix()函数中文帮助文档(中英文对照)

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sampleCorrelations.matrix(aroma.light)
sampleCorrelations.matrix()所属R语言包：aroma.light

                                        Calculates the correlation for random pairs of observations
                                         计算随机对观测的相关

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculates the correlation for random pairs of observations.
计算随机对观测的相关性。


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：X
An NxK matrix where N >= 2 and K >= 2.
NxKmatrix其中N> = 2和K> = 2。


参数：MARGIN
The dimension (1 or 2) in which the observations are. If MARGIN==1 (==2), each row (column) is an observation.
维度（1或2）的意见。如果MARGIN==1（==2），每一行（列）是一个观察。


参数：pairs
If a Lx2 matrix, the L index pairs for which the correlations are calculated. If NULL, pairs of observations are sampled.
如果LX2matrix，信用证对指数的相关性计算。如果NULL，对观测采样。


参数：npairs
The number of correlations to calculate.
相关计算。


参数：...
Not used.
不使用。


值----------Value----------

Returns a double vector of length npairs.
返回一个doublevector长度npairs。


作者（S）----------Author(s)----------


Henrik Bengtsson (<a href="http://www.braju.com/R/">http://www.braju.com/R/</a>)



参考文献----------References----------

Correlation test to assess low-level processing of high-density oligonucleotide microarray data. BMC Bioinformatics, 2005, vol 6.

参见----------See Also----------

sample().
sample（）。


举例----------Examples----------



# Simulate 20000 genes with 10 observations each[各10个观测与模拟的20000基因]
X <- matrix(rnorm(n=20000), ncol=10)

# Calculate the correlation for 5000 random gene pairs[5000随机基因对计算相关]
cor <- sampleCorrelations(X, npairs=5000)
print(summary(cor))


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