R语言 apComplex包 apEX()函数中文帮助文档(中英文对照)

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apEX(apComplex)
apEX()所属R语言包：apComplex

                                        Example data set for apComplex package
                                         示例数据为apComplex包

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A matrix and corresponding graph of AP-MS purifications from a small hypothetical experiment.
A矩阵和相应的AP-MS纯化图从一个小的假想实验。


用法----------Usage----------


data(apEX)
data(apEXG)



Details

详情----------Details----------

apEX is a matrix of hypothetical AP-MS data.  The 4 rows correspond to bait proteins and the 8 columns correspond to proteins found as hits in the hypothetical experiment and are named accordingly. The first 4 column names are the same as the 4 row names; bait proteins can also be found as hits by other baits, hence their inclusion as columns in apEX.  An entry of "1" in the ith row and jth column of apEX indicates that bait protein i found protein j as a hit.  All other entries are "0".  There are a total of 9 "1" entries in the matrix, corresponding to 9 comemberships detected in the experiment.
apEX是一个假设的AP-MS数据的矩阵。 4行对应诱饵蛋白和8列对应点击在假想的实验中发现的蛋白质，并命名为相应。第4列名4行名称相同，也可作为诱饵蛋白可以点击其他诱饵，因此其作为列入apEX列。 apEX在第i行第j列的“1”的条目，我发现蛋白作为一击j表明，诱饵蛋白。所有其他项目均为“0”。有共9“1”项，在矩阵相应的实验检测9 comemberships。

apEXG is a graphNEL object in which 8 nodes represent proteins and 9 directed edges represent comemberships detected in the purification.  Each directed edge originates at the bait and ends at the hit.  Each edge in apEXG corresponds to an entry of "1" in the apEX matrix.
“apEXGgraphNEL对象，其中8个节点代表蛋白质和9向边代表在净化检测comemberships。每个导演的边缘，起源于诱饵和命中结束。每个apEXG边缘对应进入apEX矩阵中“1”。

These data are used in the apComplex vignette.
这些数据被用来在apComplex小插曲。


举例----------Examples----------


data(apEX)
apEX

data(apEXG)
adj(apEXG,"P1")

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