R语言 SKAT包 Generate_SSD_SetID()函数中文帮助文档(中英文对照)

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Generate_SSD_SetID(SKAT)
Generate_SSD_SetID()所属R语言包：SKAT

                                        Generate SNP set data file (SSD)
                                         生成SNP集数据文件（SSD）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generate a SNP set data file (SSD) from binary plink formated data files using user specified SNP sets. If you want to use plink formated data files, you must generate the SSD files first.
生成一个SNP集数据文件（SSD）从二进制砰砰格式的数据文件，使用用户指定的SNP集。如果你想使用砰砰格式的数据文件，你必须首先产生的SSD的文件。


用法----------Usage----------


        Generate_SSD_SetID(File.Bed, File.Bim, File.Fam, File.SetID,
         File.SSD, File.Info)



参数----------Arguments----------

参数：File.Bed
the name of the binary ped file (BED).
二进制PED认证文件的名称（BED）。


参数：File.Bim
the name of the binary map file (BIM).
二进制映射文件的名称（BIM）。


参数：File.Fam
the name of the FAM file (FAM).
的FAM文件的名称（FAM）。


参数：File.SetID
the name of the Snp set ID file which defines SNP sets. The first column of the file must be Set ID, and the second column must be SNP ID. There should be no header!!  
设置SNP套组ID的文件，它定义SNP的名称。该文件的第一列中，必须设置ID，和第二列必须是SNP ID。应该没有头！


参数：File.SSD
the name of the SSD file generated.  
产生的SSD文件的名称。


参数：File.Info
the name of the SSD info file generated.  
SSD信息文件的名称产生的。


Details

详细信息----------Details----------

The SetID file is white-space (space or tab) delimitered file with 2 columns: SetID and SNP_ID.
SETID文件是空白（空格或制表符）2的列：SETID和SNP_ID delimitered文件。

Please keep in mind that there should be no header!! The SNP_IDs and SetIDs should be less than 25 characters, otherwise, it will return error message.
请记住，应该没有头！应该是的SNP_IDs和SetIDs小于25个字符，否则，它会返回错误消息。

The SSD file is a binary formated file with genotype information.  The SSD info file is a text file. The first 6 rows have general information of data and SNP sets. The information of each set can be found from the 8th row.
SSD的文件是一个二进制格式的文件基因型信息。 SSD信息文件是一个文本文件。第6行的数据和SNP组的一般信息。每个集合的信息，可以从第8行中找到。


（作者）----------Author(s)----------


Seunggeun Lee, Larisa Miropolsky

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注：
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