summary.snpSurv(SimHap)
summary.snpSurv()所属R语言包:SimHap
Summarizing Single SNP analysis models for survival data
单核苷酸多态性分析模型的生存数据综述
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Summary method for objects of class snpSurv
摘要方法的类的对象的snpSurv
用法----------Usage----------
## S3 method for class 'snpSurv'
summary(object, ...)
## S3 method for class 'summary.snpSurv'
print(x, digits = max(3, getOption("digits") - 3),
signif.stars = getOption("show.signif.stars"), ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
an object of class snpSurv
一个对象的类snpSurv
参数:x
an object of class summary.snpSurv, the result of a call to <PRE>summary.snpSurv.</PRE>
一个对象的类summary.snpSurv,一个调用到<PRE> summary.snpSurv的结果。</ PRE>
参数:digits
the number of significant digits to use when printing.
打印时所使用的数量显著数字。
参数:signif.stars
logical. If TRUE, “significance stars" are printed for each coefficient.
逻辑。如果TRUE,“意义明星”打印每个系数。
参数:...
further arguments passed to or from other methods.
进一步的参数传递给其他方法。
值----------Value----------
summary.snpSurv returns an object of class summary.snpSurv, a list with components
summary.snpSurv返回一个对象,组件类summary.snpSurv“的列表
参数:terms
terms attribute of formula1 called in snp.surv.
条款属性的公式叫snp.surv。
参数:coefficients
summarized results from fitted model, including hazard ratios and p-values.
汇总结果拟合模型,包括风险比和p-值。
参数:formula
formula1 used in snp.surv.
formula1在snp.surv使用。
参数:LRT
likelihood ratio test comparing the model with SNP variables compared to the model without SNPs.
似然比检验比较模型相比,模型,而不单核苷酸多态性SNP变量。
参数:Wald
Wald statistic for the fitted model.
Wald统计量的拟合模型。
参数:rsquared
adjusted r-squared values for the fitted model.
调整后的R平方值的拟合模型。
参数:residuals
the residuals, that is response minus fitted values.
残差,,是响应减去拟合值。
(作者)----------Author(s)----------
Pamela A. McCaskie
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
snp.surv
snp.surv
实例----------Examples----------
data(SNPsurv.dat)
# transforms SNPlong.dat to an object containing 3 columns[转换到一个对象,它包含3列的SNPlong.dat]
# per SNP - additive, dominant and recessive, where genotypes[每个SNP - 添加剂,显性和隐性的,其中基因型]
# defined in 'baseline' serve as the baseline genotypes[中定义的“基线”作为基线基因型]
survGeno.dat <- SNP2Geno(SNPsurv.dat, baseline=c("V2V2", "GG", "CC"))
data(survPheno.dat)
mymodel <- snp.surv(formula1=Surv(time, status)~age+SNP_1_add,
formula2=Surv(time, status)~age, pheno=survPheno.dat,
geno=survGeno.dat)
summary(mymodel)
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