makeOrgPackageFromNCBI(AnnotationDbi)
makeOrgPackageFromNCBI()所属R语言包:AnnotationDbi
Making an organism package from annotations available from NCBI.
从NCBI注释从一个有机体包。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The makeOrgPackageFromNCBI function allows the user to make an organism package from NCBI annotations available from the NCBI.
makeOrgPackageFromNCBI功能,使用户能够从NCBI的注释可从NCBI一个有机体包。
用法----------Usage----------
makeOrgPackageFromNCBI(
version=,
maintainer,
author,
outputDir=".",
tax_id,
genus,
species)
参数----------Arguments----------
参数:version
What is the version number for this package?
这个包的版本号是什么?
参数:maintainer
Who is the package maintainer? (must include email to be valid)
软件包的维护者是谁? (必须是有效的,包括电子邮件)
参数:author
Who is the creator of this package?
这个包的创建者是谁?
参数:outputDir
A path where the package source should be assembled.
一个包的源路径应组装。
参数:tax_id
The Taxonomy ID that represents your organism. (NCBI has a nice online browser for finding the one you need)
分类编号,代表您的有机体。 (NCBI的有找到你需要一个很好的网上浏览器)
参数:genus
Single string indicating the genus.
属单字符串,指示。
参数:species
Single string indicating the species.
单字符串,指示物种。
值----------Value----------
Nothing returned to the R session. Just creates an organism
没有返回R会话。仅仅是创建一个有机体
作者(S)----------Author(s)----------
M. Carlson
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
## Makes an organism package for Zebra Finch from NCBI:[#使生物体从NCBI的斑马雀包:]
makeOrgPackageFromNCBI(version = "0.1",
author = "Some One <so@someplace.org>",
maintainer = "Some One <so@someplace.org>",
outputDir = ".",
tax_id = "59729",
genus = "Taeniopygia",
species = "guttata")
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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