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R语言 SimHap包 epi.quant()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-30 02:46:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
epi.quant(SimHap)
epi.quant()所属R语言包:SimHap

                                        Epidemiological analysis for quantitative outcomes
                                         定量结果的流行病学分析

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

epi.quant is used to fit linear regression models to single SNP genotype and phenotype data for a continuous Normal outcome.
epi.quant线性回归模型来拟合单个SNP的基因型和表型数据的连续正常结果。


用法----------Usage----------


epi.quant(formula, pheno, sub = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:formula
a symbolic description of the full model to be fit. The details of model specification are given below.
一个象征性的描述,完整的模型是合适的。模型规范的细节在下面给出。


参数:pheno
a dataframe containing phenotype data.
一个数据框的表型数据。


参数:sub
an expression representing a subset of the data on which to perform the models.
的数据的一个子集的表达式,表示在其上执行的模型。


Details

详细信息----------Details----------

formula should be in the form of response ~ predictor(s). A formula has an implied intercept term. See documentation for formula function for more details of allowed formulae.
formula应该是的形式response ~ predictor(s)。公式有一个隐含的截距项。 formula功能允许的公式的详细信息,请参阅文档。


值----------Value----------

epi.quant returns an object of class epiQuant containing the following items
epi.quant返回一个对象类epiQuant包含以下项目


参数:formula
formula passed to epi.quant.
公式传递到epi.quant。


参数:results
a table containing the coefficients, standard errors and p-values of the parameter estimates.
一个表中包含的系数,标准误差及p-值的参数估计。


参数:fit.lm
a lm object fit using formula.
lm对象适合使用公式。


参数:ANOD
analysis of deviance table for the model fit using formula.
分析偏差表的模型拟合公式。


参数:logLik
the log-likelihood for the linear model fit using formula.
对数似然的线性模型拟合公式。


参数:AIC
Akaike Information Criterion for the linear model fit using formula.
赤池信息准则的线性模型拟合公式。


(作者)----------Author(s)----------


Pamela A. McCaskie



参考文献----------References----------





参见----------See Also----------

snp.quant, haplo.quant, epi.bin
snp.quant,haplo.quant,epi.bin


实例----------Examples----------



data(pheno.dat)
mymodel <- epi.quant(formula=LDL~AGE+SBP, pheno=pheno.dat)
summary(mymodel)

# example with a subsetting variable, looking at males only[例如,一个子集变量,只在男性]
mymodel <- epi.quant(formula=LDL~AGE+SBP, pheno=pheno.dat,
        sub=expression(SEX==1))


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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