KEGGFrame(AnnotationDbi)
KEGGFrame()所属R语言包:AnnotationDbi
KEGGFrame objects
KEGGFrame对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
These objects each contain a data frame which is required to be composed of 2 columns. The 1st column are KEGG IDs. The second are the gene IDs that match to the KEGG IDs. There is also a slot for the organism that these anotations pertain to. getKEGGFrameData is just an accessor method and returns the data.frame contained in the KEGGFrame object and is mostly used by other code internally.
其中的每个对象包含一个数据框,须组成2列。第一列KEGG标识。第二是KEGG的ID相匹配的基因标识。还有一个插槽,这些anotations属于生物体。 getKEGGFrameData只是一个存取方法和返回在KEGGFrame对象中的数据框,大多是由其他代码内部使用。
Details
详情----------Details----------
The purpose of these objects is to create a safe way for annotation data about KEGG from non-traditional sources to be used for analysis packages like GSEABase and eventually Category.
这些对象的目的是创建一个安全的方式为KEGG被为像GSEABase最终分类分析软件包用于从非传统来源的注释数据。
举例----------Examples----------
## Make up an example[#一个例子]
genes = c(2,9,9,10)
KEGGIds = c("04610","00232","00983","00232")
frameData = data.frame(cbind(KEGGIds,genes))
library(AnnotationDbi)
frame=KEGGFrame(frameData,organism="Homo sapiens")
getKEGGFrameData(frame)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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