找回密码
 注册
查看: 695|回复: 0

R语言 AnnotationDbi包 GOFrame()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-25 11:56:17 | 显示全部楼层 |阅读模式
GOFrame(AnnotationDbi)
GOFrame()所属R语言包:AnnotationDbi

                                        GOFrame and GOAllFrame objects
                                         GOFrame和GOAllFrame对象

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These objects each contain a data frame which is required to be composed of 3 columns. The 1st column are GO IDs.  The second are evidence codes and the 3rd are the gene IDs that match to the GO IDs using those evidence codes.  There is also a slot for the organism that these anotations pertain to.
其中的每个对象包含一个数据框,这是需要3列组成。第一列是GO的ID。第二个证据代码,第三是基因的ID相匹配的GO标识使用这些证据代码。还有一个插槽,这些anotations属于生物体。


Details

详情----------Details----------

The GOAllFrame object can only be generated from a GOFrame object and its contructor method does this automatically from a GOFrame argument.  The purpose of these objects is to create a safe way for annotation data about GO from non-traditional sources to be used for analysis packages like GSEABase and eventually GOstats.
GOAllFrame对象只能从GOFrame对象和它的构造器方法生成这个自动从GOFrame参数。这些对象的目的是为来自非传统来源,可用于分析软件包像GSEABase最终GoStats上标注的数据来创建一个安全的方式。


举例----------Examples----------


  ## Make up an example[#一个例子]
  genes = c(1,10,100)
  evi = c("ND","IEA","IDA")
  GOIds = c("GO:0008150","GO:0008152","GO:0001666")
  frameData = data.frame(cbind(GOIds,evi,genes))

  library(AnnotationDbi)
  frame=GOFrame(frameData,organism="Homo sapiens")
  allFrame=GOAllFrame(frame)

  getGOFrameData(allFrame)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-1-23 21:12 , Processed in 0.020354 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表