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R语言 AnnotationDbi包 getProbeData_1lq()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:56:10 | 显示全部楼层 |阅读模式
getProbeData_1lq(AnnotationDbi)
getProbeData_1lq()所属R语言包:AnnotationDbi

                                        Read a 1lq file for an Affymetrix genechip
                                         读了一个Affymetrix基因1lq文件

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read a 1lq file for an Affymetrix genechip
读了一个Affymetrix基因1lq文件


用法----------Usage----------


getProbeData_1lq(arraytype, datafile, pkgname = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:arraytype
Character. Array type (e.g. 'Scerevisiaetiling)
字符。数组类型(例如“Scerevisiaetiling)


参数:datafile
Character. The filename of the input data file. If omitted a default name is constructed from arraytype (see this function's source code).
字符。输入数据文件的文件名。如果省略,默认的名字是arraytype(看到这个函数的源代码)。


参数:pkgname
Character. Package name. If NULL the name is derived from arraytype.
字符。包的名称。如果为NULL的名字来源于从arraytype。


Details

详情----------Details----------

This function serves as an interface between the (1) representation of array probe information data in the packages that are generated by makeProbePackage and (2) the vendor- and possibly version-specific way the data are represented in datafile.
此功能提供<X阵探针信息数据(1)表示在makeProbePackage(2)供应商和版本特定的方式表示数据在生成的包之间的接口>


值----------Value----------

A list with three components
三个组成部分的列表


参数:dataEnv
an environment which contains the data frame with the probe sequences and the other probe data.
环境,其中包含了与探针序列和其他探测数据的数据框。


参数:symVal
a named list of symbol value substitutions which can be used to customize the man pages. See createPackage.
命名的符号价值,可用于定制的手册页换人名单。看到createPackage。


参数:pkgname
a character with the package name; will be the same as the function parameter pkgname if it was specified; otherwise, the name is constructed from the parameter arraytype.
一个包的名称字符;将作为函数的参数pkgname如果它被指定相同的,否则,这个名字是从参数arraytype兴建。


参见----------See Also----------

makeProbePackage
makeProbePackage


举例----------Examples----------


## makeProbePackage([#makeProbePackage(]
##    arraytype = "Scerevisiaetiling",[#arrayType的=“Scerevisiaetiling”]
##    maintainer= "Wolfgang Huber &lt;huber@ebi.ac.uk&gt;",[#维护者=“沃尔夫冈·胡伯<huber@ebi.ac.uk>”]
##    version   = "1.1.0",[#版本=“1.1.0”]
##    datafile  = "S.cerevisiae_tiling.1lq",[#数据文件=“S.cerevisiae_tiling.1lq”]
##    importfun = "getProbeData_1lq")[#importfun“getProbeData_1lq”)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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