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R语言 AnnotationDbi包 available.db0pkgs()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:55:12 | 显示全部楼层 |阅读模式
available.db0pkgs(AnnotationDbi)
available.db0pkgs()所属R语言包:AnnotationDbi

                                        available.db0pkgs
                                         available.db0pkgs

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Get the list of intermediate annotation data packages (.db0 data packages) that are currently available on the Bioconductor repositories for your version of R/Bioconductor.
获取中间的注释数据包(DB0。数据包),目前可以用您的版本的R / Bioconductor Bioconductor库列表。

Or get a list of schemas supported by AnnotationDbi.
或获得由AnnotationDbi支持的模式列表。


用法----------Usage----------


  available.db0pkgs()
  available.dbschemas()
  available.chipdbschemas()



Details

详情----------Details----------

The SQLForge code uses a series of intermediate database packages that are necessary to build updated custom annotation packages.  These packages must be installed or updated if you want to make a custom annotation package for a particular organism.  These special intermediate packages contain the latest freeze of the data needed to build custom annotation data packages and are easily identified by the fact that they end with the special ".db0" suffix.  This function will list all such packages that are available for a specific version of bioconductor.
SQLForge代码使用了一系列的中间数据库包,有必要建立更新的自定义注解包。这些软件包必须安装或更新,如果你想自定义注解包为特定的有机体。这些特殊的中间包中包含最新的冻结需要建立自定义注解的数据包的数据,很容易被认定的事实,他们用特殊的“。DB0”后缀结束。此功能将列出所有可用于特定版本的bioconductor包。

The available.dbschemas() and available.chipdbschemas() functions allow you to get a list of the schema names that are available similar to how you can list the available ".db0" packages by using available.db0pkgs().  This list of shemas is useful (for example) when you want to build a new package and need to know the name of the schema you want to use.
的available.dbschemas()和available.chipdbschemas()函数允许你得到的是如何可以列出可用的类似的架构名称列表“。DB0”包使用available.db0pkgs()。这shemas是有用的(例如)当你想建立一个新的软件包,需要知道你要使用的架构的名称。


值----------Value----------

A character vector containing the names of the available ".db0" data packages.  Or a a character vector listing the names of the available schemas.
字符向量“。DB0”数据包的名称。或AA的特征向量,列出可用的架构的名称。


作者(S)----------Author(s)----------


H. Pages and Marc Carlson



举例----------Examples----------


  # Get the list of BSgenome data packages currently available:[获取列表BSgenome数据包目前可用:]
  available.db0pkgs()

  ## Not run: [#无法运行:]
    # Make your choice and install like this:[让您的选择和安装这样:]
    source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
    biocLite("human.db0")
  
## End(Not run)[#结束(不运行)]

  # Get the list of chip DB schemas:[获取芯片DB模式的名单:]
  available.chipdbschemas()

  # Get the list of ALL DB schemas:[获取所有DB模式的列表:]
  available.dbschemas()


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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