R语言 annotate包 updateSymbolsToValidKeys()函数中文帮助文档(中英文对照)

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updateSymbolsToValidKeys(annotate)
updateSymbolsToValidKeys()所属R语言包：annotate

                                        Take a list of symbols and translate them into the best possible
                                         符号的列表，并翻译成他们最好的

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a list of gene symbols and a package, find a valid ID for that package.  If there isn't a valid ID, then return the original symbol.
鉴于基因符号和包的列表，找到了该包的有效身份证件。如果没有一个有效的ID，然后返回原来的符号。


用法----------Usage----------


updateSymbolsToValidKeys(symbols, pkg)



参数----------Arguments----------

参数：symbols
A character vector containing gene symbols that you wish to try and translate into valid IDs.
字符向量的基因符号，你不妨试试，并转化成有效身份证件。


参数：pkg
The package name of the chip for which we wish to validate IDs.
我们要验证标识的芯片封装名称。


Details

详情----------Details----------

This is a convenience function for getting from a possibly varied list of gene symbols mapped onto something that is a nice concrete ID such as an entrez gene ID.  When such an ID cannot be found, the original symbol will come back to prevent the loss of any information.
这是一个从Entrez基因标识，如混凝土ID是一个很好的东西，到对应的基因符号的可能是多样的名单越来越方便的功能。当无法找到这样一个ID，原始符号会回来的，以防止损失的任何信息。


值----------Value----------

This function returns a vector of IDs corresponding to the symbols that were input.  If the symbols don't have a valid ID, then they come back instead.
这个函数返回的ID符号，输入相应的向量。如果符号没有一个有效的ID，然后他们回来代替。


作者（S）----------Author(s)----------


Marc Carlson



参见----------See Also----------

isValidKey
isValidKey


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
  ## one "bad" ID, one that can be mapped onto a valid ID, and a 3rd[一个“坏”的ID，一个可以映射到一个有效的ID，和3]
  ## which already is a valid ID[＃这已经是一个有效的ID]
  syms <- c("15S_rRNA_2","21S_rRNA_4","15S_rRNA")
  updateSymbolsToValidKeys(syms, "org.Sc.sgd")

  ## 3 symbols and a 4th that will NOT be valid[3＃符号和4日将是无效的]
  syms <- c("MAPK11","P38B","FLJ45465", "altSymbol")
  updateSymbolsToValidKeys(syms, "org.Hs.eg")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。