R语言 annotate包 PMIDAmat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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PMIDAmat(annotate)
PMIDAmat()所属R语言包：annotate

                                        A function to compute the probe to PubMed id incidence matrix.
                                         一个函数来计算探针医学ID关联矩阵。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For a given chip or a given set of genes, it computes the mapping from probes to PubMed id.
对于一个给定的芯片或给定的基因，它计算从探针医学ID的映射。


用法----------Usage----------


PMIDAmat(pkg, gene=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：pkg
The package name of the chip for which the incidence matrix should be computed.
的发病矩阵应计算芯片的包的名称。


参数：gene
A character vector of interested probe set ids or NULL (default).
感兴趣的探针组ID或NULL（默认值）的一个特征向量。


Details

详情----------Details----------

Not much to say, just find which probes are associated with which PubMed ids and return the incidence matrix, with PubMed ids as rows and probes as columns.
没有什么好说的，只要找到探针与相关医学IDS，返回医学IDS的关联矩阵，行和列的探针。

To specify a set of probes to use, let the argument gene to be a vector of probe ids.   Bt this way, the calculations are not involved with non-interested genes/PubMed ids so that the whole process could finish soon.  
要指定一组使用探针，让我们的说法gene探针IDS向量，。 BT这种方式，计算不涉及与有兴趣的非基因/医学IDS，使整个过程很快就可以完成。


值----------Value----------

A matrix containing zero or one, depending on whether the probe (column) is associated with a PubMed id (row).
包含零个或一个矩阵，取决于探针（柱）是否与医学ID（行）。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman



举例----------Examples----------


  library("hgu95av2.db")
  probe <- names(as.list(hgu95av2ACCNUM))
  Amat <- PMIDAmat("hgu95av2", gene=sample(probe, 10))

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