RidgeogramPlot(SigWinR)
RidgeogramPlot()所属R语言包:SigWinR
Plot a RIDGEOGRAM
绘制一个RIDGEOGRAM
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Basic RIDGEOGRAM plotter.
基本RIDGEOGRAM绘图仪。
用法----------Usage----------
RidgeogramPlot(ridgeogram, pval=0.05, ptitle = "Ridgeogram", high.col = "red", low.col = "blue")
参数----------Arguments----------
参数:ridgeogram
ridgeogram to plot. If not given it will be calculated
ridgeogram图。如果没有给出将计算
参数:pval
the highes p-value given a color in the graph
p-值的最高水平在图形中的一种颜色
参数:ptitle
title of the graph
图形的标题
参数:high.col
color used to show positive significant windows
所使用的颜色显示出积极的重要窗口
参数:low.col
color used to show negative significant windows
所使用的颜色呈现负重大的窗口
Details
详细信息----------Details----------
In the plot the ridgeogram is plotted along with the sequence used as input of the graph.
在小区的ridgeogram一起绘制序列用作输入图形。
(作者)----------Author(s)----------
w.c.deleeuw@uva.nl
参考文献----------References----------
enriched windows of genomic features related to DNA sequences Marcia A Inda, Marinus F van Batenburg, Marco Roos, Adam SZ Belloum, Dmitry Vasunin, Adianto Wibisono, Antoine HC van Kampen, and Timo M Breit
参见----------See Also----------
Ridgeogram()
Ridgeogram()
实例----------Examples----------
RidgeogramPlot(Ridgeogram(0.5*rnorm(124)+cos(seq(0.1,12.4,by=0.1))));
lseq <- c(rnorm(200),rnorm(100,-1),rnorm(50),rnorm(50,4.0),rnorm(100))
rg <- Ridgeogram(lseq)
RidgeogramPlot(rg,0.05,"Example ridgeogram",high.col="green",low.col="red")
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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