R语言 sigora包 get_marker_genes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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get_marker_genes(sigora)
get_marker_genes()所属R语言包：sigora

                                         Pathway unique genes (PUGs)
                                         通路的独特基因（哈巴狗）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function returns the list of genes that are uniquely associated with a single pathway in the repository - we call these 'Pathway Unique Genes' (PUGs). Use idb_to_genename on the results of this function to see the actual gene names.
这个函数返回列表中的唯一关联的基因库中的一个单一的途径 - 我们称这些途径的独特基因“（哈巴狗）。使用此功能的结果idb_to_genename上看到实际的基因名称。


用法----------Usage----------


get_marker_genes(is_human = TRUE, archive = "keg")



参数----------Arguments----------

参数：is_human
leave this to its default value if interested in a list of human PUGs in the archive/repository. Setting this to FALSE returns PUGs where available.   
离开这为它的默认值，如果有兴趣的归档/存储库列表中的人的哈巴狗。将其设置为FALSE回报哈巴狗（如有）。


参数：archive
The repository: choose from 'keg'(default),'reactome','pid'(for BIOCARTA),'nci','inoh'.  
资料库：选择“桶”（默认值），“reactome，PID（为BIOCARTA）的，”美国国立癌症研究所“，”inoh。


实例----------Examples----------


## Not run: [＃不运行：]
# returns list of human marker genes in KEGG as SIGORA IDs[返回的人的标记基因在KEGG作为SIGORA的ID列表]
markergenes<-sigora:::get_marker_genes(archive='keg')
# convert the above results to human readable gene names.[转换上述的结果，人类可读的基因名称。]
idb_to_genename(tmp)
############## To do the same for BIOCARTA:[＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃为了做同样的BIOCARTA：]
markergenes2 <-sigora:::get_marker_genes(archive='pid')
idb_converter(markergenes2)

## End(Not run)[＃（不执行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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