R语言 annotate包 isValidKey()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

isValidKey(annotate)
isValidKey()所属R语言包：annotate

                                        Get or verify valid IDs for a package.
                                         获取或验证一个包的有效身份证件。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions either verify that a list of IDs are primary and valid IDs for a package, or else return all the valid primary IDs from a package
这些功能验证一个ID列表包小学和有效身份证件，否则返回从包中的所有有效的主标识


用法----------Usage----------


isValidKey(ids, pkg)
allValidKeys(pkg)



参数----------Arguments----------

参数：ids
A character vector containing IDs that you wish to validate.
字符向量的ID，你想验证。


参数：pkg
The package name of the chip for which we wish to validate IDs.
我们要验证标识的芯片封装名称。


Details

详情----------Details----------

Every package has some kind of ID that is central to that package. For chip-based packages this will be some kind of probe, and for the organism based packages it will be something else (usually an entrez gene ID).  isValidKey takes a list of IDs and tests to see whether or not they are present (valid) in a particular package.  allValidKeys simply returns all the valid primary IDs for a package.
每包有一些ID，这是该软件包的核心。基于芯片的封装，这将是一些探针，并为基于包的有机体，它会是别的东西（通常是Entrez基因ID）。 isValidKey需要一个ID和测试列表，看是否他们是在一个特定的包（有效）。 allValidKeys简单地返回一个包的所有有效的主要标识。


值----------Value----------

isValidKey returns a vector of TRUE or FALSE values corresponding to whether or not the ID is valid.
isValidKey返回一个TRUE或FALSE值对应的ID是否是有效的向量。

allValidKeys returns a vector of all the valid primary IDs.
allValidKeys返回一个有效的主ID的所有向量。


作者（S）----------Author(s)----------


Marc Carlson



参见----------See Also----------

updateSymbolsToValidKeys
updateSymbolsToValidKeys


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
  ## 2 bad IDs and a 3rd that will be valid[＃2坏的ID和一个第三，这将是有效的]
  ids <- c("15S_rRNA_2","21S_rRNA_4","15S_rRNA")
  isValidKey(ids, "org.Sc.sgd")

  ## 2 good IDs and a 3rd that will not be valid[＃2好ID和一个第三，将不再有效]
  ids <- c("5600","7531", "altSymbol")
  isValidKey(ids, "org.Hs.eg")

  ## Get all the valid primary id from org.Hs.eg.db[＃获取所有从org.Hs.eg.db有效的主ID。]
  allValidKeys("org.Hs.eg")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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