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R语言 annotate包 GO2heatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:50:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
GO2heatmap(annotate)
GO2heatmap()所属R语言包:annotate

                                        Compute a heatmap for the specified data, for either a GO
                                         为指定的数据计算1热图,一个好

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For a given GO category or KEGG pathway, all probes in the supplied data are mapped to the pathway and a heatmap is produced.
对于一个给定的类别或去KEGG通路,所有探针提供的数据映射到的途径产生热图。


用法----------Usage----------


GO2heatmap(x, eset, data, ...)
KEGG2heatmap(x, eset, data, ...)



参数----------Arguments----------

参数:x
The name of the category or pathway.
类别或通路的名称。


参数:eset
An ExpressionSet providing the data.
ExpressionSet提供的数据。


参数:data
The name of the chip.
芯片的名称。


参数:...
Additional parameters to pass to heatmap.
额外的参数来传递heatmap。


Details

详情----------Details----------

For the given pathway or GO category all matching probes are determined, these are used to subset the data and heatmap is invoked on that set of data. Extra parameters can be passed through to heatmap using the ... parameter. The annotation slot of the eset argument is used to determine the appropriate annotation data to use.
对于所有匹配的探针确定的途径或类别,这些子集的数据和heatmap调用,数据集。额外的参数,可以通过heatmap使用...参数。 annotation槽的eset参数是用来确定使用相应的注释数据。


值----------Value----------

The value returned by heatmap is passed back to the user.
heatmap返回值被传递回给用户。


作者(S)----------Author(s)----------


R. Gentleman



参见----------See Also----------

heatmap
heatmap


举例----------Examples----------


  library("hgu95av2.db")
  data(sample.ExpressionSet)
  KEGG2heatmap("04810", sample.ExpressionSet, "hgu95av2")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-5-30 21:39:59 | 显示全部楼层
{:soso_e154:}
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发表于 2012-5-30 21:47:45 | 显示全部楼层
("hgu95av2.db")
这个包怎么载不下来。。{:soso_e149:}
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