R语言 annotate包 getSEQ()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getSEQ(annotate)
getSEQ()所属R语言包：annotate

                                        Queries the NCBI database to obtain the sequence for a given
                                         查询NCBI数据库中获得一个给定的顺序

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a GenBank Accession number, getSEQ queries the NCBI database for the nucleotide sequence.  
鉴于GenBank登录号，getSEQ查询NCBI数据库中的核苷酸序列。


用法----------Usage----------


getGI(accNum)
getSEQ(gi)



参数----------Arguments----------

参数：accNum
accNum a character string for a GenBank Accession number (i.e. M22490)
accNumGenBank登录号为字符串（即M22490）


参数：gi
gi a character string or numeric numbers for a GenBank accession number or gi number. A gi number is a series of digits that are assigned consecutively to each sequence record processed by NCBI
gi字符串或数字号码为GenBank登录号或GI数量。GEO标志数量是一系列连续被分配到每个序列由NCBI的纪录处理的数字


Details

详情----------Details----------

The NCBI database is queried for the given GenBank Accession number to obtain the nucleotide sequence in FASTA format. The leading identification line of the sequence data is then dropped to return only the nucleotide sequence.  
NCBI数据库GenBank登录号查询获得FASTA格式的核苷酸序列。领先的识别序列数据线，然后下降到只有返回的核苷酸序列。

getGI returns the gi number corresponding to a given GenBank accession number.
getGI返回GI号码对应一个给定的GenBank登录号。


值----------Value----------

getSEQ returns a character string of nucleotide sequence
getSEQ返回字符串的核苷酸序列


作者（S）----------Author(s)----------


Jianhua Zhang



参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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