genbank(annotate)
genbank()所属R语言包：annotate
A function to open the browser to Genbank with the selected gene.
函数打开浏览器到GenBank选定的基因。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a vector of Genbank accession numbers or NCBI UIDs, the user can either have a browser display a URL showing a Genbank query for those identifiers, or a XMLdoc object with the same data.
鉴于GenBank登录号或NCBI的UID的向量，用户可以在浏览器显示一个URL，显示了这些标识符的序列查询，或xmlDoc中具有相同的数据对象。
用法----------Usage----------
genbank(...,disp=c("data","browser"), type=c("accession","uid"),
pmaddress=.efetch("gene", disp, type))
参数----------Arguments----------
参数：...
Vectorized set of Genbank accession numbers or NCBI UIDs
矢量GenBank登录号或NCBI的UID的设置
参数：disp
Either "Data" or "Browser" (default is data). Data returns a XMLDoc, while Browser will display information in the user's browser.
“数据”或“浏览器”（默认为数据）。数据返回xmlDoc中，而浏览器将显示在用户的浏览器的信息。
参数：type
Denotes whether the arguments are accession numbers or UIDS. Defaults to accession values.
表示参数是否加入数字或UID的。加入值的默认。
参数：pmaddress
Specific path to the pubmed efetch engine from the NCBI website.
具体路径PubMed的efetch引擎从NCBI网站。
Details
详情----------Details----------
A simple function to retrieve Genbank data given a specific ID, either through XML or through a web browser. This function will accept either Genbank accession numbers or NCBI UIDs (defined as a Pubmed ID or a Medline ID) - although the types must not be mixed in a single call.
检索GenBank中的数据给出一个特定的ID，可以通过XML或通过网络浏览器，一个简单的函数。此函数将接受任何GenBank登录号或NCBI的的UID（定义为医学ID或论文编号） - 虽然不能混在一个单一的通话类型。
WARNING: The powers that be at NCBI have been known to ban the IP addresses of users who abuse their servers (currently defined as less then 2 seconds between queries). Do NOT put this function in a tight loop or you may find your access revoked.
警告：在NCBI的权力，已被禁止滥用自己的服务器（目前定义查询之间小于2秒）的用户的IP地址。不要把这个功能在一个紧凑的循环，或者您可能会发现您的访问撤销。
值----------Value----------
If the option "data" is used, an object of type XMLDoc is returned, unless there was an error with the query in which case an object of type try-error is returned.
如果“数据”选项被使用，返回类型xmlDoc中的对象，除非有一个错误类型的尝试错误的对象，在这种情况下，返回查询。
If the option "browser" is used, nothing is returned.
如果使用“浏览器”选项，并没有返回。
作者（S）----------Author(s)----------
R. Gentleman
参见----------See Also----------
pubmed, xmlTreeParse
pubmed，xmlTreeParse
举例----------Examples----------
## Use UIDs to get data in both browser & data forms[＃使用的UIDs来获得浏览器及数据表格中的数据]
if ( interactive() ) {
disp <- c("data","browser")
} else {
disp <- "data"
}
for (dp in disp)
genbank("12345","9997",disp=dp,type="uid")
## Use accession numbers to retrieve browser info[＃使用加入号码检索浏览信息]
if ( interactive() )
genbank("U03397","AF030427",disp="browser")
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 11:49:16
