找回密码
 注册
查看: 830|回复: 0

R语言 annotate包 accessionToUID()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-25 11:47:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
accessionToUID(annotate)
accessionToUID()所属R语言包:annotate

                                        A function to convert accession values to NCBI UIDs.
                                         函数加入值转换到NCBI的UID。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given one or more accession values, this function will attempt to convert them into NCBI UID values.
由于一个或多个加入值,此功能将尝试转换成NCBI的UID值。


用法----------Usage----------


accessionToUID(...,db=c("genbank","pubmed"))



参数----------Arguments----------

参数:...
Accession numbers to be transformed.
加入号码进行改造。


参数:db
Which database this accession number refers to, defaults to Genbank
此加入数字是指哪一个数据库,默认为序列


Details

详情----------Details----------

Utilizes the PubMed tool pmqty.cgi to convert an accession number into a valid NCBI UID number.
利用医学工具pmqty.cgi的转换成一个有效的NCBI UID号登录号。

WARNING:  The powers that be at NCBI have been known to ban the IP addresses of users who abuse their servers (currently defined as less then 2 seconds between queries).  Do NOT put this function in a type loop or you may find your access revoked.
警告:在NCBI的权力,已被禁止滥用自己的服务器(目前定义查询之间小于2秒)的用户的IP地址。不要把此功能或类型的循环中,您可能会发现您的访问撤销。


值----------Value----------

Returns either a valid NCBI UID value or NULL (if there was nothing available).
返回一个有效的NCBI的UID值或NULL(如果有没有可用的)。


作者(S)----------Author(s)----------


Jeff Gentry



参见----------See Also----------

pubmed, xmlTreeParse
pubmed,xmlTreeParse


举例----------Examples----------



     ## The two returns from genbank should be the same[#从GenBank中两个回报应该是相同的]
     xdoc <- genbank("U03397",type="accession",disp="data")
     x <- accessionToUID("U03397",db="genbank")
     xdoc <- genbank(x, type="uid",disp="data")

     ## Can handle multiple inputs[#可以处理多个输入]
     y <- accessionToUID("M16653","U892893",db="genbank")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-1-23 15:03 , Processed in 0.019365 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表