bertinplot(seriation)
bertinplot()所属R语言包：seriation
Plot a Bertin matrix
绘制一个贝尔坦矩阵
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot a data matrix of cases and variables. Each value is represented by a symbol. Large values are highlighted. The matrix can be rearranged to make structure in the data visible (see Falguerolles et al 1997). bertin_cut_line() can be used to add cut lines (see Details).
画出的情况下，变量的数据矩阵。每个值表示的一个符号。较大的值会被高亮显示。该矩阵可重新安排，以使在可见的数据结构（见Falguerolles等人1997）。 “”bertin_cut_line()可以用来添加切割线（见详情）。
用法----------Usage----------
bertinplot(x, order = NULL, highlight = TRUE, options = NULL)
参数----------Arguments----------
参数：x
a data matrix. Note that following Bertin, columns are variables and rows are cases. This behavior can be reversed using reverse = TRUE in options.
一个数据矩阵。请注意贝尔坦，列变量和行的一些情况。这种行为是可以逆转的使用reverse = TRUE中options。
参数：order
an object of class ser_permutation to rearrange x before plotting. If NULL, no rearrangement is performed.
对象的类ser_permutation重排x，然后再绘制。如果NULL，没有重排。
参数：highlight
a logical scalar indicating whether to use highlighting. If TRUE, all variables with values greater than the variable-wise mean are highlighted. To control highlighting, also a logical matrix with the same dimensions as x can be supplied.
一个逻辑标量，指示是否使用高亮显示。如果TRUE，所有变量的值大于可变明智的平均突出。要控制的高亮显示，同时作为一个逻辑矩阵x可以提供具有相同的尺寸。
参数：options
a list with options for plotting. The list can contain the following elements:
绘图选项的列表。该列表可以包含以下元素：
panel.function a function to produce the symbols. Currently available functions are panel.bars (default), panel.circles, panel.squares, panel.blocks and panel.lines. For circles and squares neg. values are represented by a dashed border. For blocks all blocks are the same size (can be used with shading=TRUE).
panel.function函数产生的符号。目前可提供的功能是panel.bars（默认），panel.circles，panel.squares，panel.blocks和panel.lines。对于圆形和方形负。值由虚线边框。块的块大小相同（可以使用shading=TRUE）。
reverse logical indicating whether to swap cases and variables in the plot. The default (FALSE) is to plot cases as columns and variables as rows.
reverse逻辑，指出是否要交换情况下，变量中的图。默认值（FALSE）作为行，列和变量的情况下，绘制。
xlab, ylab labels (default: use labels from x).
xlab, ylab标签（默认：标签x）的使用。
spacing relative space between symbols (default: 0.2).
spacing之间的相对空间符号（默认值：0.2）。
shading use gray shades to encode value instead of highlighting (default: FALSE).
shading使用灰色色调编码值，而不是高亮显示（默认值：FALSE）。
frame plot a grid to separate symbols (default: codeFALSE).
frame绘制一个网格单独的符号（默认：codeFALSE）的。
mar margins (see par).
mar利润（见par“）。
gp_labels gpar object for labels (see gpar).
gp_labels的GPAR对象的标签（见gpar“）。
gp_panels gpar object for panels (see gpar).
gp_panels的GPAR对象的面板（见gpar“）。
newpage a logical indicating whether to start the plot on a new page (see grid.newpage).
newpage逻辑是否启动一个新的页面（见grid.newpage）的图。
popa logical indicating whether to pop the created viewports (see pop.viewport)? </table>
pop逻辑表示是否要弹出的创建视口（见pop.viewport）？ </ TABLE>
Details
详细信息----------Details----------
The plot is organized as a matrix of symbols. The symbols are drawn by a panel function, where all symbols of a row are drawn by one call of the function (using vectorization). The interface for the panel function is panel.myfunction(value, spacing, hl). value is the vector of values for a row scaled between 0 and 1, spacing contains the relative space between symbols and hl is a logical vector indicating which symbol should be highlighted.
图被组织为一个矩阵的符号。这些符号是由面板的功能，其中所有符号的行的功能由一个呼叫（使用矢量）绘制绘制。接口面板功能panel.myfunction(value, spacing, hl)。 value是介于0和1之间的一排缩放矢量的值，spacing包含之间的相对空间的符号和hl是一个逻辑矢量的指示应当被增亮的符号。
Cut lines can be added to an existing bertin plot using bertin_cut_line(x=NULL, y=NULL). x/y is can be a number indicating where to draw the cut line between two columns/rows. If both x and y is specified then one can select a row/column and the other can select a range to draw a line which does only span a part of the row/column. It is important to call bertinplot() with the option pop=FALSE.
切割线可以被添加到一个现有的BERTIN使用bertin_cut_line(x=NULL, y=NULL)的图。 x/y是可以是一个数字，表示绘制的切割线两行/列。如果两个x和y指定，那么可以选择的行/列和其他可以选择的范围划一条线，它跨越的行/列的一部分。这是重要的，调用bertinplot()与选项pop=FALSE。
参考文献----------References----------
de Falguerolles, A., Friedrich, F., Sawitzki, G. (1997): A Tribute to J. Bertin's Graphical Data Analysis. In: Proceedings of the SoftStat '97 (Advances in Statistical Software 6), 11–20.
参见----------See Also----------
ser_permutation, seriate, Package grid.
ser_permutation，seriate，包装grid。
实例----------Examples----------
data("Irish")
scale_by_rank <- function(x) apply(x, 2, rank)
x <- scale_by_rank(Irish[,-6])
## use the the sum of absolute rank differences[＃利用绝对的等级差异的总和]
order <- c(
seriate(dist(x, "minkowski", p = 1)),
seriate(dist(t(x), "minkowski", p = 1))
)
## plot[＃图]
bertinplot(x, order)
## some alternative displays[＃显示一些替代]
bertinplot(x, order, options = list(shading = TRUE, panel = panel.blocks))
bertinplot(x, order, options = list(panel = panel.lines))
bertinplot(x, order, options = list(panel = panel.squares))
bertinplot(x, order,
options = list(panel = panel.circles, spacing = -0.5))
## plot with cut lines (we manually set the order here)[＃图切割线（我们手动设置的顺序）]
order <- ser_permutation(c(21, 16, 19, 18, 14, 12, 20, 15,
17, 26, 13, 41, 7, 11, 5, 23, 28, 34, 31, 1, 38, 40,
3, 39, 4, 27, 24, 8, 37, 36, 25, 30, 33, 35, 2,
22, 32, 29, 10, 6, 9),
c(4, 2, 1, 6, 8, 7, 5, 3))
bertinplot(x, order, options=list(pop=FALSE))
bertin_cut_line(,4) ## horizontal line between rows 4 and 5[＃行4和5之间的水平线]
bertin_cut_line(,7) ## separate "Right to Life" from the rest[＃单独的“生命权”的其余部分]
bertin_cut_line(14,c(0,4)) ## separate a block of large values (vertically)[＃分离的大的值的块（垂直）]
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发表于 2012-9-30 01:29:21
