R语言 seqinr包 synsequence()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

synsequence(seqinr)
synsequence()所属R语言包：seqinr

                                        Random synonymous coding sequence generation
                                         随机同义编码序列生成

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generates a random synonymous coding sequence, according to a certain codon usage bias
产生一个随机的代名词编码序列，根据在一定的密码子使用偏


用法----------Usage----------


synsequence(sequence, numcode = 1, ucoweight = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：sequence
A nucleic acids sequence  
一个核酸序列


参数：numcode
The genetic code number as in translate  
遗传密码如translate


参数：ucoweight
A list of weights containing the desired codon usage bias as generated by ucoweight  
权重列表包含所需的密码子使用偏好所产生的ucoweight


值----------Value----------

a sequence translating to the same protein sequence as the original one (cf. translate), but containing synonymous codons  
作为原来的（参见translate），但含有同义密码子的相同的蛋白质序列翻译的序列


（作者）----------Author(s)----------


Leonor Palmeira



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

ucoweight
ucoweight


实例----------Examples----------


  data(ec999)
  sequence=ec999[1][[1]]
  synsequence(sequence,1,ucoweight(sequence))

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