R语言 seqCBS包 readSeqChiang()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

readSeqChiang(seqCBS)
readSeqChiang()所属R语言包：seqCBS

                                         Read data formatted as in Chiang (2009)
                                         阅读数据格式化在清迈（2009年）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read data formatted as in Chiang (2009), which we recommend using.
读取数据格式化为在清迈（2009年），我们建议您使用。


用法----------Usage----------


readSeqChiang(filename)



参数----------Arguments----------

参数：filename
The file name of the data set
的数据集的文件名


Details

详细信息----------Details----------

This format requires minimal memory and contains all relevant information for this program. It is a table with two columns, first being the chromosome of the mapped read, and the second being the position of the read in the chromosome. One line for each observation. In case of paired read, we only use the front read (whichever has a smaller position label) and ask that you use only that for input.
这种格式需要很少的内存，并包含这个程序的所有相关信息。它是一个表有两列，第一染色体映射的读取，和第二即在染色体中的读出的位置。一号线每个观测。在配对读的情况下，我们只使用了前读（具有更小的位置标签为准），并请您只使用的输入。


值----------Value----------

<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>seqF </td> <td> Read position for each read</td></tr> <tr valign="top"><td>seqChr </td> <td> Chromosome of each mapped read</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> seqF </ TD> <TD>阅读位置对每个读</ TD> </ TR> <TR VALIGN =“顶“> <TD> seqChr  </ TD> <TD>染色体的每一个对应的读</ TD> </ TR> </ TABLE>


（作者）----------Author(s)----------



Jeremy J. Shen




参考文献----------References----------

Chiang et al., Nature Methods, 2009, Vol.6 No.1

参见----------See Also----------

readSeq, readSeqChiang, readSeqELANDPaired
readSeq，readSeqChiang，readSeqELANDPaired


实例----------Examples----------


# This shows the format of this type of data[这表明这种类型的数据的格式的]
data(JSSim_NormalSim1)
print(head(JSSim_NormalSim1))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。