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R语言 AgiMicroRna包 readTargets()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:39:31 | 显示全部楼层 |阅读模式
readTargets(AgiMicroRna)
readTargets()所属R语言包:AgiMicroRna

                                        read the target file
                                         读取目标文件

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The target file is a txt file created by the user  where every input file (array, sample) is attached to a experimental condition
目标文件是由每一个输入文件(阵列,样品)连接到实验条件的用户创建一个txt文件


用法----------Usage----------


        readTargets(infile,verbose=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:infile
name of the target file, for instance 'targets.micro.txt'  
目标文件的名称,例如“targets.micro.txt”


参数:verbose
logical, if TRUE prints out output
逻辑,如果TRUE打印出输出


Details

详情----------Details----------

In the 'target' file (see Table 1 in vignette) we specify the  experimental conditions under which the data have been generated.  The target file MUST contain the following mandatory columns: -FileName        : Name of the array data file -Treatment        : Treatment effect   -GErep                : Treatment effect  in numeric code, from  '1' to 'n', being 'n' the number of the levels of the treatment effect
在“目标”的文件(见表1中的小插曲)我们指定的实验条件下,根据该数据已经生成。目标文件必须包含下列强制列:文件名:名称:阵列的数据文件的处理治疗效果GErep:数字代码的治疗效果,从1,N,N的数量水平的治疗效果

Other explanatory variables specifying the experimental conditions might be also included.
可能还包括其他解释变量指定的实验条件。


值----------Value----------

A 'data.frame' containing by the columns specified in the input file targets.txt. This 'targets.txt' file must be created by the user.  
在输入文件targets.txt指定列包含一个数据框“。这“targets.txt文件必须由用户创建的。


作者(S)----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参考文献----------References----------

'Bioinformatics and Computational Biology Solutions using R and Bioconductor'. R. Gentleman, V. Carey, S. Dudoit, R. Irizarry, W. Huber (eds), Springer, New York, pages 397–420.

参见----------See Also----------

An example of a target file can be found in targets.micro
一个目标文件的例子可以发现targets.micro

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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