R语言 AgiMicroRna包 pvalHistogram()函数中文帮助文档(中英文对照)

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pvalHistogram(AgiMicroRna)
pvalHistogram()所属R语言包：AgiMicroRna

                                         Histogram of the p values
                                         p值的直方图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates an histogram of the pvalues. For multiple contrats, creates an histogram for every t.test pvalue (separate) or a single histogram for the F.test pvalue (nestedF). A uniform histogram will indicate no differential expression in the data set, whereas a right skewed histogram, will indicate some significant differential expression
创建直方图的pvalues。多个contrats，创建直方图每t.test pvalue（独立）或单直方图F.test pvalue（nestedF）。一个统一的直方图会显示没有数据集的差异表达，而右倾斜直方图，将显示一些显着的差异表达


用法----------Usage----------


pvalHistogram(fit2, DE, PVcut, DEmethod, MTestmethod, CM,verbose=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：fit2
MArrayLM object
MArrayLM对象


参数：DE
TestResults object  
TestResults的对象


参数：PVcut
  limit p value to declare significant features
限制p值申报显着的特点


参数：DEmethod
method for decideTests, only 'separate' or 'nestedF' are implemented  
decideTests方法，只有独立或nestedF“实施


参数：MTestmethod
method for multiple test  
多种测试方法


参数：CM
contrast matrix  
对比矩阵


参数：verbose
logical, if TRUE prints out output  
逻辑，如果TRUE打印出输出


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

An overview of miRNA differential expression analysis is given in basicLimma An example of how to get the 'TestResults' object is in getDecideTests
miRNA的差异表达分析概述basicLimma如何获得“TestResults的对象的一个例子是getDecideTests


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
pvalHistogram(fit2,DE,PVcut=0.10,
     DEmethod="separate",MTestmethod="BH",CM)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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